CellProfiler是一款免费的开放源代码的软件，它让生物学家可以从数千张图片中定量测量细胞的显性类型。CellProfiler可以自动找到某一图片中所有的细胞，然后测量每个细胞的参数。De Novo软件和CellProfiler的开发者进行了合作，让用户在FCS Express 4中可以分析大批量图像数据。用户数据被恰当地从CellProfiler导出后，FCS Express可以导入这些数据，把用户的数据集显示在大家都熟知的二维绘图以及一些新的绘图类型，例如图像绘图和热图上。

  在本教程的前两节中，你将学到:

注意: 本教程不会讨论如何创建和使用CellProfiler中的管道功能。本教程将主要针对如何修改已有的管道文件，以把数据导出为FCS Express可以读入的格式。

 

首先，我们来做一些设置，以便从CellProfiler中导出96孔板数据。