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格式化DNA柱状图

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格式化DNA柱状图

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格式化DNA柱状图

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FCS Express中有很多格式化功能,它们帮助用户对多周期DNA柱状图分析做一个视觉上的评估。不同的细胞周期细胞群可以有不同的阴影,用户可以显示某一细胞群中间值对应的标记。另外,用户可以在柱状图上对某一区域进行放大,以便更细致地查看绘图。

首先让我们在多周期柱状图上把二倍体细胞群的颜色修改为单色。

1.请点击多周期柱状图将其选中。
2.请选中Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Overlays(叠加图层)命令。

这时会出现Formatting Overlays(格式化叠加图层)对话框,如图T19.23所示。以下步骤均针对图T19.23。

3.请从左边选中Diploid G1(二倍体G1),如图中的蓝色所示。
4.请从下拉菜单中的Fill Style(填充样式)中选择单色,如图中的光标所示。
5.请点击OK

 

图T19.23  Formatting Overlays Dialog for a MultiCycle DNA Histogram (多周期DNA柱状图的格式化叠加图层对话框)

图T19.23  Formatting Overlays Dialog for a MultiCycle DNA Histogram (多周期DNA柱状图的格式化叠加图层对话框)

 

这时多周期柱状图会进行更新,反映出图T19.24中进行的修改。或者,我们可以右键点击DNA柱状图,调出弹出菜单,选择Format(格式),然后选择Overlays(叠加图层)来对柱状图叠加图层进行格式化。

 

图T19.24  MultiCycle DNA Histogram Updated with Solid Fill on the Diploid Peak (更新后的多周期DNA柱状图中的单色二倍体数据峰)

图T19.24  MultiCycle DNA Histogram Updated with Solid Fill on the Diploid Peak (更新后的多周期DNA柱状图中的单色二倍体数据峰)

 

现在我们要在柱状图上添加一个标记,表明非整倍体G2峰值的位置。

6.请右键点击DNA柱状图,调出弹出菜单。
7.请从菜单上选择DNA Position Markers(DNA位置标识)→A2 Mean(A2平均值),如图T19.25中的光标所示。

 

图T19.25  Selecting DNA Position Markers on the Pop-up Menu (从弹出菜单上选择DNA位置标识)

图T19.25  Selecting DNA Position Markers on the Pop-up Menu (从弹出菜单上选择DNA位置标识)

 

或者,DNA位置标识可从弹出菜单上的Format(格式)一项来调出。

请右键点击柱状图,调出弹出菜单。
请从菜单是选中Format(格式)

这时会出现柱状图格式化窗口,以下步骤均针对图T19.26。

请从左边的类别选项选中DNA→Position Markers(位置标识),如图中的淡蓝色显示。
请选中Show position marker on the plot(在绘图上显示位置标记)复选框,如图中的光标所示。
请选中A2 Mean(A2平均值),如图中的蓝色高亮所示。
请点击OK

 

图T19.26  Formatting DNA Histogram Position Markers (格式化DNA柱状图位置标识)

图T19.26  Formatting DNA Histogram Position Markers (格式化DNA柱状图位置标识)

 

这时在多周期DNA柱状图上非整倍体G2信号峰的平均值位置处会出现一条垂直线(图T19.27)。

 

图T19.27  MultiCycle Histogram Updated with a DNA Position Marker on the Aneuploid G2 Mean (更新过的多周期柱状图以及代表非整倍体G2平均数的DNA位置标识)

图T19.27  MultiCycle Histogram Updated with a DNA Position Marker on the Aneuploid G2 Mean (更新过的多周期柱状图以及代表非整倍体G2平均数的DNA位置标识)

 

我们现在要在DNA柱状图上进行放大,来更近地考察一下非整倍体细胞群。

8.请右键点击DNA柱状图,调出弹出菜单。
9.请从弹出菜单上选中Magnify (Axis)(放大(轴))(图T19.25)。

以下步骤均针对图T19.28。

10. 请把光标放在DNA柱状图上非整倍体G1数据峰的左侧。
11. 请按下鼠标左键向右移。
12. 当向右的箭头在DNA位置标识的右侧时,请松开鼠标(如图中的光标所示)。

 

图T19.28  Selecting an Area on the X-axis to Zoom (在X-轴上选中一个区域来进行放大)

图T19.28  Selecting an Area on the X-axis to Zoom (在X-轴上选中一个区域来进行放大)

 

柱状图这时已经进行了更新,放大到前几步选中的x-轴部分,如图T19.29所示。

 

图T19.29  Histogram Zoomed (放大后的柱状图)

图T19.29  Histogram Zoomed (放大后的柱状图)

 

我们现在要修改柱状图上的y-向坐标。

13. 请点击柱状图,将其选中。
14. 请选中Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Axes(坐标轴)命令。

这时会出现Formatting Axes(格式化坐标轴)对话框。以下步骤请参考图T19.30。

15. 请选中Y-Axis(Y-轴),如图中的蓝色高亮所示。
16. 请点击Automatic(自动)旁边的复选框,取消对该选项的选择,如图中的光标所示。
17. 请输入"300",作为Y-轴的最大值,如图中的蓝色高亮所示。
18. 点击OK

 

图T19.30  Formatting Axes Dialog (格式化坐标轴对话框)

图T19.30  Formatting Axes Dialog (格式化坐标轴对话框)

 

这时多周期柱状图会进行更新,y-轴的范围变成0到300,如图T19.31所示。

 

图T19.31  MultiCycle Histogram with Rescaled Y-axis (多周期柱状图以及调整后的Y-轴)

图T19.31  MultiCycle Histogram with Rescaled Y-axis (多周期柱状图以及调整后的Y-轴)

 

在下一节中,我们将对3周期数据使用多周期分析