FCS数据一般是在线性或对数坐标下采集的，适当的缩放比例存储在FCS数据文件的文件头。尽管FCS Express支持在对数坐标下显示线性数据，但数据一般按其采集时的坐标显示。

 

对数坐标的缺点是它不可显示零以下的数值。这一点限制软件做数据补偿，因为常常很大一部分补偿数据是在“零以下”的通道。用对数坐标显示时，负值因被放在坐标轴上而常常被忽略，导致过度补偿数据。

 

为克服这个限制，开发了几种其它的数据轴坐标系。这些坐标系的特点是它们在接近零的地方是线性，而在远离零的地方为对数。这些坐标系也可被定义为显示零以下的数据。线性坐标和对数坐标相结合的坐标系称为混合型坐标系。这方面更多资料可在以下文献中找到：

 

•Herzenberg LA, Tung J, Moore WA, Herzenberg LA, Parks DR。Interpreting flow cytometry data: a guide for the perplexed(解释流式细胞术数据：为您迷途指津)。Nat Immunol2006;7:681-685。

 

•Parks DR, Roederer M, Moore WA。A New "Logicle" Display Method Avoids Deceptive Effects of Logarithmic Scaling for Low Signals and Compensated Data。Cytometry A2006；69A:541-545。

 

•Bagwell CB.Hyperlog – A Flexible Log-like Transform for Negative, Zero, and Positive Valued Data。Cytometry A2005;64A:34-42。

 

•Battye FL.A Mathematically Simple Alternative to the Logarithmic Transform for Flow Cytometric Fluorescence Data Displays。Cytometry A2006;69A:413-414。

 

FCS Express支持以下坐标体系：

 

•线性 ? 标准线性坐标系

 

•对数 ? 标准对数坐标系

 

•带负值的对数坐标 ? 一个改良的对数坐标系

         

 

 

一般对数函数中不定义零和负值，如果它们是在补偿时采集到的，它们一般显示为叠放在数轴上的事件，就如常见的补偿后的数据。在带负数的对数函数中，如果遇到负数，计算其绝对值的对数，然后显示在数轴的负值部分，有效的创建一个“负对数”显示，该值是其绝对值的镜像。零数值仍然放在数轴上。

 

•Biexponential(双指数)

 

双指数体系被BD FACSDiva软件普及化。因为我们和BD的密切合作，FCS Express现在支持FACSDiva在显示双指数数据方面的所有选项。实际上，我们引入了FACSDiva的计算反射点的专有算法，因此FCS Express的结果看起来和FACSDiva软件的结果完全一样。

 

•Hyperlog™ 2坐标系 ? 描述于Bagwell文章中，见上方。

 

•Lin/Log 坐标系? 描述于Battye文章中，见上方。

 

         

 

该转变在过渡点以下完全是线性，在其之上完全是对数。系数a和c相匹配保证在过渡点的连续性。

 

•ArcSinh(反双曲正弦)

 

ArcSinh(反双曲正弦) 的反双曲函数广泛应用于CyTOF流式细胞仪产生的.fcs文件。通过将反双曲正弦方程应用到原始强度的值除以辅因子而得到反双曲正弦值。“辅因子”定义的是０周边线性区的大小，较小的辅因子代表更长的线性区域。

         ArcSinh

 

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