在这一章节,我们将:
使用上一章节创建的"BShift"和"TShift"自定义标记数据,来在数据网格中定义标记分类器("NEG"、"POS"和"WEAK")。我们将用这些标记分类器来对样本进行分类,最后决定病人血清匹配的结果。首先,我们要插入一个新的、有三列、四行的数据网格,我们后面要把最后的结果放在其中。
1. | 请在FCS Express Sample Data(FCS Express样本数据)文件夹中打开HLA Custom Custom_Tokens_Completed.fey版面。 |
我们现在将开始定义标记分类器,以对版面中第3页底部数据网格中的所有样本结果进行分类。要了解更过关于“创建标记分类器”的知识,请参见“使用文本框和标记”教程。
2. | 请点击'B Result'列中的第一个单元格。 |
此时,Insert a token(插入一个标记)对话框将出现,您会注意到在Custom(自定义)类别选项下方有列表。
4. | 从Insert a token(插入一个标记)对话框中Insert a token(插入一个标记)Statistic Classifier(统计分类器)。 |
此时,Create Statistic Classifier(创建统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别将出现,如图T15.33所示。在这里,我们将定义统计分类器,把我们的结果分类为'NEG(阴性)'、'WEAK(弱阳性)'以及'POS(阳性)'。但是,首先我们需要告诉分类器我们将对什么进行分类。
6. | 点击位于“Enter a value to classify(输入要分类的数值)”字段之后的标记图标,如图T15.33中光标所示。 |

Figure T15.33 Create Statistic Classifier Dialog -- Classification Category
此时,Insert a token(插入一个标记)对话框将出现,如图T15.34所示。在此,我们将为我们的标记分类器选择要分类的自定义标记。
7. | 从Insert a token(插入一个标记)对话框中的Custom(自定义)项目类别中Insert a token(插入一个标记)“BShift PBS”,如图 T15.37中的蓝色高亮显示。 |

Figure T15.34 Insert a Token Dialog with Custom Tokens to Classify
此时,Create Statistic Classifier(创建统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别将再次出现。但是,现在'Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值)'字段已经列出了自定义标记'BShift PBS',如图T15.35所示。下面我们就为分类器输入一个具体的分类列表。
9. | 点击Add(添加)按钮,如图T15.35中光标所示。 |

Figure T15.35 Adding the List of Classifiers in the Create Statistic Classifier Dialog
此时,Create Classification(创建分类)对话框将出现。以下步骤均参考图T15.36。
10. | 请在Classify the Token as(把标记归类为)文本域出输入“NEG”。 |
11. | 请在if its value is between(如果标记的值在...和...之间)文本域出输入“0”。 |
12. | 请在and(和)文本域出输入“19999”。 |

Figure T15.36 Edit Classification Dialog
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别将出现。但现在,List of classifications:(分类规则列表)字段已经有'NEG'分类规则列在那里。我们刚才把'BShift'自定义标记的'NEG'分类规则定义为在0到19,999之间。这就是说,如果样本中B细胞的MESF FITC荧光中间值在减去PBS NEGATIVE CONTROL之后小于20,000,那么该样本就被分到阴性或'NEG'一类。
现在让我们来继续定义其它的两个分类'WEAK'和'POS'。
15. | 请在Create Classification(创建分类规则)对话框中的Classify the token as(把标记归类为)文本字段处输入'WEAK'。 |
16. | 请在if its value is between(如果标记的值在...和...之间)文本字段处输入'20000'。 |
17. | 请在and(和)文本字段处输入'49999'。 |
20. | 请在Classify the token as(把标记归类为)文本字段处输入'POS'。 |
21. | 请在if its value is between(如果标记的值在...和...之间)文本字段处输入'50000'。 |
22. | 请在and(和)文本字段处输入'1200000'。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)对话框将出现,其看起来应该如图T15.37 所示,上面显示了针对'BShift'自定义标记的、完整的分类器定义。

Figure T15.37 The 'B Result' Token Classifier Definition
这时'HLA Results'数据网格也进行了更新,显示出在'B Result'一列的第一个单元格中添加的标记分类器,如图T15.38所示。

Figure T15.38 Token Classifier for the 'B Result' Column
既然我们已经创建了'B Result'列可以使用的分类器,我们便可以把这个分类器复制到这一列中其它的单元格中。但是,我们需要做的是对标记分类器进行编辑,以使用相应的样本数据。
25. | 请复制我们在前一步中刚刚创建的'BShift PBS'自定义标记分类器。 |
26. | 请把'BShift PBS'自定义标记分类器粘贴到'HLA Results'数据网格中第二个单元格的编辑器中。 |
现在我们需要对标记分类器进行格式化,使得它可以使用AB NEGATIVE HUMAN SERUM样本中的BShift自定义标记。
26. | 请在数据网格编辑器'Classification of: 0.00'上双击。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Display Text(显示文本)项目类别将出现。
27. | 选择Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别。 |
我们现在来标记要被分类的值。
28. | 请从Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值:)文本字段中删除'Custom Token: BShift PBS'。 |
29. | 点击位于Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值:)文本域后面的标记图标。 |
此时,Insert a token(插入一个标记)对话框将出现。在此,我们将选择另外一个自定义标记进行分类。
30. | 从Insert a token(插入一个标记)对话框的Custom(自定义)项目类别中选择“BShift NegSerum”。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别将再次出现。但现在,Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值:)文本字段中已有自定义标记'BShift NegSerum'。现在我们将重复上边的这些步骤,把"B Result"列中剩下的单元格填好。
33. | 请为'B Result'列中的第三个单元格重复第26步到第32步。但在第41步,请选择“BShift PosSerum”。 |
34. | 请为'B Result'列中的第四个单元格重复第26步到第32步。但在第41步,请选择“BShift Patient”。 |
这时,'HLA Results'数据网格中的'B Result'列就完整了,看起来应如图T15.39所示。

Figure T15.39 Completed 'B Result' Column
现在我们将使用'TShift'自定义标记来为'T Result'列定义标记分类器。
35. | 请选择'B Result'列中的第一个单元格。 |
36. | 请复制标记分类器'Classification of: 0.00'。 |
37. | 请选择'T Result'列中的第一个单元格。 |
38. | 请把标记分类器粘贴到'T Result'列里第一个单元格的编辑器中。 |
39. | 请双击标记分类器“Classification of: 0.00”,来对其进行编辑。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Display Text(显示文本)项目类别将出现。
40. | 请选择Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)项目类别中Classification(分类)项目类别。 |
我们将对分类的值以及分类规则列表进行编辑。以下步骤均参考图T15.40。
41. | 从List of classifications:(分类规则列表:)列表框选择NEG: 0 to 19999 ,如图中的蓝色高亮所示。 |

Figure T15.40 Editing the 'T Result' Token Classifier
此时,Edit Classification(编辑分类)对话框将出现。在此,我们将修改'NEG'的上限。
43. | 请在and(和)文本字段中把'19999'改为'1999'。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)对话框下的Classification(分类)类别选项将再次出现,并且其中的'NEG'被重新定义为从0到1,999之间。我们现在将继续编辑'WEAK'和'POS'两个分类。
45. | 请在List of classifications:(分类规则列表:)列表框选中“WEAK: 20000 to 49999”。 |
47. | 请把if its value is between(如果标记的值在...和...之间)文本字段中的'20000'改为'2000'。 |
48. | 请在and(和)文本字段中把'49999'改为'7999'。 |
50. | 请选中List of classifications:(分类规则列表:)列表框中的“POS: 50000 to 1200000”。 |
52. | 请在if its value is between(如果标记的值在...和...之间)文本字段中把'50000'改为'8000'。 |
现在,我们要把需进行分类的标记从自定义标记'BShift PBS'改为自定义标记'TShift PBS'。
54. | 请从Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值:)文本字段中删除“Custom Token: BShift PBS”。 |
55. | 点击位于Enter a value to classify:(输入一个要进行分类的值:)文本窗口后的标记图标。 |
此时,Insert a token(插入一个标记)对话框将出现。
56. | 从Insert a token(插入一个标记)对话框的Custom(自定义)项目类别中选择“TShift PBS”。 |
此时,Edit Statistic Classifier(编辑统计分类器)对话框将再次出现,看起来应该如图T15.41所示,上面显示了针对'TShift PBS'自定义标记的一个完整的分类器定义。

Figure T15.41 Classifier Definitions of the 'TShift PBS' Custom Token for the 'T Result' Column
我们现在已经为'TShift PBS'自定义标记创建了分类规则列表。接下来,我们要把这个分类器应用到'T Result'列中其它的'TShift'自定义标记上。最简单的方法就是把'T Result'列中的第一个单元格中的'TShift PBS'自定义标记分类器复制到列中的其它单元格中。
59. | 请为'T Result'列重复第25步到第34步,只是把'BShift'自定义标记替换为'TShift'自定义标记。 |
当完成所有的复制、粘贴以及编辑标记分类器后,'HLA Results'数据网格将会整个被填满,看起来应该如图T15.42所示。

Figure T15.42 Completed 'HLA Results' Data Grid
现在,我们在数据表中创建了所有的自定义标记和分类器,那么我们可以保存这个版面,并把它应用到其它数据组上。因为大多数的数据网格都只使用标记,所以数据值会随着绘图的更新而更新。