在本例中，我们会：

•打开一个以前创建的版面。
•创建矩形门、椭圆形门、多边形门以及自由形门。
•更改一个数据文件。
•在二维绘图上创建一个一维门。
•用标识来创建一维门。
•把象限转化为门。

 

用户在跟着本教程练习过程中，可以使用自己的数据，也可以使用本教程提供的样本数据。样本数据文件可在Tutorial Sample Data archive(教程样本数据库)中找到。本章节中，将用到section5.fey版面、ApoMono.001及ApoMono.002数据文件。

 

要打开一个版面：

 

1.请选择File(文件)标签→Open(打开)(图T3.1)。
2.请选择选择位于Tutorial Sample Data archive(教程样本数据库) 中的section5.fey版面。
3.请选择Data(数据)→Change Data on All Objects(修改所有对象上的数据)→Select(选中)命令，来在绘图中插入数据文件(图T3.4)。
4.请在Tutorial Sample Data archive(教程样本数据库)中选择 ApoMono.001 FCS文件。
5.点击Open(打开)。

 

版面应该看起来如图T4.0所示。

 

Figure T4.0 Section5 layout after file loading

Figure T4.0 Section5 layout after file loading

 

下面我们将在版面绘图中插入四种不同类型的门。

创建门最方便的方法是使用Home(主页)和Gating(门操作)标签中的Create Gates(创建门)命令组中的命令来完成(图T4.1)，且除了标识(一维)以外，所有门均可通过在二维绘图的弹出菜单上选择Create Gate(创建门)命令来完成(右键点击绘图来调出弹出菜单)。这些门操作命令请见图T4.1，对它们的解释见下边的表格。

注意：如何对从多孔细胞盘里获取的数据进行门操作，将在之后章节中介绍(参见Analyzing Data in Heat Maps(分析热图中的数据)章节)。

 

Figure T4.1  Gating Commands

Figure T4.1  Gating Commands

 

Symbol(图标)

Description(描述)

number1

插入椭圆形门

number2

插入矩形门

number3

插入多边形门

number4

插入自由形门

number5

插入标识

number6

插入象限

 

如果把鼠标移动到Create Gates(创建门)命令组中的任何一个命令上方，系统会显示一个关于该命令的描述信息。

 

要查看门操作命令提示信息(图T4.2)：

5.请把鼠标移动到Rectangle(矩形 )门 按钮上方。
6.保持鼠标半秒钟不动。

 

Figure T4.2  Gating Command Hint

Figure T4.2  Gating Command Hint

 

 

 

要创建矩形门：

7.请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Rectangle(矩形门)命令(图T4.1number2)。

命令被选中时，该按钮会有一个不同的颜色背景，提示用户该选项处于点中状态RectangularGateIcon。

 

我们会在密度图的左上方来创建一个矩形门(被称为“Create the rectangulargate on this plot(在该绘图上创建矩形门)")(图T4.3)。

 

Figure T4.3  Density Plot for First Gating Excercise

Figure T4.3  Density Plot for First Gating Excercise

 

8.将光标移动到绘图中您想要矩形门开始的位置。
9.按下鼠标，并按住不放。
10.将光标移动到绘图中您想要矩形门终止的位置(图T4.4)。
11.放开鼠标键。
Figure T4.4  Creating Rectangular Gate

Figure T4.4  Creating Rectangular Gate

 

此时，Create New Gate(创建新门)对话框将出现(图T4.5)。请为新门取个名称。

 

Figure T4.5  Create New Gate Dialog

Figure T4.5  Create New Gate Dialog

 

12.请在Create a new gate named(创建一个新门名称)编辑域中输入"Whole Cells"。
13.点击OK键，来接受该名称。

 

这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6)。

 

Figure T4.6  Newly Created Rectangular Gate

Figure T4.6  Newly Created Rectangular Gate

 

注意：在第7-12步骤中的任何时间，您可以通过按下键盘上的ESC键来取消对门的创建。该操作可应用于所有类型的门。

 

要创建椭圆形门：

14.请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Ellipse(椭圆形门)命令(图T4.1number1)。

命令被选中时，该按钮会有一个不同的颜色背景，提示用户该选项处于点中状态EllipseGateIcon。

 

我们将在绘图的右上角创建一个椭圆形门(被称作"Create the elliptical gate on this plot(在该绘图上创建椭圆形门)")。

 

15.跟着上面的第8-11步来创建一个椭圆形门。
16.请在Create a new gate named(创建一个新门名称)编辑域中输入"Cells in ellipse"。
17.按下OK键，来接受该名称。

 

这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6b)。

 

Figure T4.6b Newly Created Elliptical Gate

Figure T4.6b Newly Created Elliptical Gate

 

要创建多边形门：

我们将在密度图的左下方创建一个多边形门(被称作"Create the polygon gate on this plot(在该绘图上创建多边形门)")。

18.请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Polygon(多边形门)命令(图T4.1number3)。

命令被选中时，该按钮会有一个不同的颜色背景，提示用户该选项处于点中状态PolygonGateIcon。

19.将光标移动到绘图中您想要添加多边形门第一个顶点的位置。
20.按下鼠标左键。该多边形门的第一个顶点就被创建好了。
21.将光标移动到绘图中您想要添加多边形门第二个顶点的位置。
22.按下鼠标左键。该多边形门的第二个顶点就被创建好了。
23.请重复第19-22步，直到你想要关闭该多边形门。
24.通过点击您创建的第一个顶点，来讲多边形门封闭。或者，用户可以按下空格键来关闭该多边形。

 

此时，Create New Gate(创建新门)对话框将出现，如图T4.5所示。请为新门取个名称：

 

25.请在Create a new gate named(创建一个新门名称)编辑域中输入"Cells in a polygon"。
26.点击OK键，来接受该名称。

 

这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.7)。

Figure T4.7  Polygon Gate

Figure T4.7  Polygon Gate

 

 

要创建自由形门：

我们将在密度图的右下方创建自由形门(被称作“Create the freeform gate on this plot(在该绘图上创建自由形门)")。

27.请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Freeform(自由形门)命令(图T4.1number4)。

命令被选中时，该按钮会有一个不同的颜色背景，提示用户该选项处于点中状态FreeformGateIcon。

 

28. 请把光标移动到想要开始创建自由形门的位置。
29.按下鼠标左键不放。
30.请移动鼠标来画出想要的形状，在移动过程中请不要松开鼠标。画门的过程中，会有一条线跟着光标，显示门会在哪儿出现。
31.请松开鼠标来完成该门的创建(图T4.8)。

 

此时，Create New Gate(创建新门)对话框将出现，如图T4.5所示。请为新门取个名称：

32.请在Create a new gate named(创建一个新门名称)编辑域中输入"Cells in freeform"。
33.点击OK键，来接受该名称。

 

这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6b)。

 

Figure T4.8  Freeform Gate

Figure T4.8  Freeform Gate

 

 

 

在下一节中，我们将在二维绘图上创建一个一维门。

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