柱状图减法运算工具

柱状图减法运算,通过样本柱状图减去阴性对照柱状图,能够让用户知道样本柱状图的阳性百分比。柱状图减法运算,可在个体柱状图中执行,也可在一系列柱状图中执行,它可自动计算并显示结构到统计窗口中。

 

要让柱状图减法运算自动执行,并将结果展示在统计窗口:

 

请确保统计窗口中,阳性百分比列是可见的

 

使用Format(格式)Plot Options(绘图选项)Specific Options(特定选项)命令(或者右键点击柱状图,然后选择Format(格式),选择Histogram (柱状图)Histogram Specific Options(柱状图特定选项)项目类别)。设置Control Histogram for Histogram Subtraction Statistics(柱状图减法统计的对照柱状图)域为适当的阴性对照(图141)。柱状图减法统计常使用Overton Subtraction(Overton减法),描述如下。

 

 

Figure 14.1  Setting the Control Histogram in the Formatting Hisotgram Specific Options Dialog

Figure 14.1  Setting the Control Histogram in the Formatting Hisotgram Specific Options Dialog

 

 

要执行一个体柱状图减法运算,请选择Data(数据)Calculate(计算)Histogram Subtraction(柱状图减法)命令,此时,Histogram Subtraction(柱状图减法)窗口将显示(图142)。

 

 

Figure 14.2  Histogram Subtraction Window

Figure 14.2  Histogram Subtraction Window

 

 

 

可以为当前打开的任何FCS文件执行柱状图减法运算。请为对照柱状图和样本柱状图,在合适的位置选择File(文件)Parameter(参数)Control(对照)或者Sample Gate()选项。按下Calculate(计算)按钮,来执行柱状图减法。4种方法计算出的阳性百分比,通常Overton减法和Positive Difference(正差异)法计算出来的是最准确的。

 

可用以下方法计算% Positive(阳性百分比):

 

Channel by channel(通道对通道)

 

在通道对通道的基础上,从样本柱状图中减去对照柱状图。换句话说,也就是用样本的N通道的事件数减去对照的N通道的事件数。用所以的阳性事件数(也就是,样本N通道的事件数比对照N通道的事件数多多少),然后除以总的事件数,就得到阳性细胞百分比了。

 

XPercent(X百分比)

 

这一方法是,在对照细胞群的最大荧光处,设置一截止通道值,认为所以高于该值的就是阳性细胞。要确定截止通道值,就在Percent(百分比)标签字段处输入一值。如果您输入2,截止通道值是对照细胞的最高的前2%,或者第98个百分位。样本柱状图中,所有高于这一通道值得细胞,都被认为是阳性细胞。

 

Overton Subtraction(Overton减法)

 

除了在更低的通道中,添加负差异(在这个位置上,对照N通道的细胞数量大于样本N通道的细胞数量)到正差异中外,该方法和通道对通道减法相似。在分析完所有的通道后,将阴性结果调到0,然后用阳性细胞数除以总细胞数,就得到样本柱状图中的阳性细胞百分比了。

 

Positive Difference(正差异)

 

计算样本柱状图和对照柱状图N通道和N-1通道间,细胞的百分比,并计算这两个百分比之间的差异。这一差异被确定为通道1和它上一个通道间的N移动。计算出的最大的差异,就是阳性百分比。

 

在柱状图数据层的Overton减法结果中,包含了所以的阳性细胞。通过在Put Overton Output Histogram On(展示Overton输出的柱状图)字段处选择一已存在的柱状图,可将该数据层放置在一柱状图上。像对柱状图上的常规数据层一样,可对该数据层进行统计操作。