CellProfiler数据导出

CellProfilerCellProfiler是一款免费的开放源代码的软件,它让生物学家可以从数千张图片中定量测量细胞的表型。CellProfiler可以自动找到某一图片中所有的细胞,然后测量每个细胞的参数。De Novo软件和CellProfiler的开发者合作,让用户在FCS Express 5中可以分析大批量图像数据。6用户数据被恰当地从CellProfiler导出后,FCS Express可以导入这些数据,把用户的数据集显示在大家都熟知的二维绘图以及一些新的绘图类型,例如图片绘图和热图上。

在本教程的前两节中,你将学习到:

如何从一个96孔的细胞盘成像实验中导出CellProfiler数据。
如何把数据导入到FCS Express中。6.

注意: 本教程不会讨论如何创建和使用CellProfiler中的管道功能(如感兴趣,请参见CellProfiler该主题内容那部分操作手册)。本教程主要介绍如何修改已有的管道文件,从而把数据导出为FCS Express可以读入的格式。