Creating an analysis Spreadsheet(创建一个分析电子表格)

在这个教程中,我们将使用一个有二维密度图的版面,这些绘图中有七个数据文件对应的门,每个数据文件对应不同浓度的CD64抗体。请注意,您可以跳到下一节使用完整的电子表格插入带回归分析的散点图

1.请选择File(文件)标签→Open From(从...打开)→Load Layout(下载布局)对话框。
2.打开建立在FCS Express Sample Data(FCS Express 样本数据)中的Titration.fey布局 在叫作Spreadsheet and Titration(电子文件和滴度)子文件夹下.

这时,会出现以下版面,如图T17.1所示。

Figure T17.1 - Titration Layout

Figure T17.1 - Titration Layout

在版面的左上角是一个点状图(Side Scatter(SS) vs. Forward Scatter(FS)),图中有一个散点门,画在红色边框中。此Scatter(散点)门已经排除了那些很低和很高的信号。版面上的所有其它绘图都用该Scatter(散点)Gate(门)七个不同体积量的CD64添加到了外周血单个核细胞中,结果显示于七个点状图上。为了定义这个滴定实验中的阴性细胞群,在淋巴细胞群上已经画了一个门,如二维绘图“Lymphs“蓝色Lymphs(淋巴细胞)门所示。阳性细胞群(也就是单核细胞群)定义为紫色的Monos(单核细胞)Gate(门)在版面的左下角,是Gate View(门视图)窗口,显示“Lymphs“Monos(单核细胞)门是Scatter(散点)门的子门,意味着这一数据第一次圈门是使用的是Scatter(散点)门,然后再进行“Lymphs“Monos(单核细胞)门圈门。

我们将使用电子表格来计算七种CD64中使用的CD64信噪比的值。这些自定义标记将被定义为单核细胞(阳性细胞)CD64的平均荧光强度除以淋巴细胞(阳性细胞)CD64的平均荧光强度的比值。

3.请选择Insert(插入)→Spreadsheet(电子表格)→New(新)命令(图T17.2)。
Figure T17.2 - Opening new spreadsheet from ribbon

Figure T17.2 - Opening new spreadsheet from ribbon

创建新的电子表格窗口将出现在版面中。

4.Name(名字)域输入 "Titration"(滴度)。
5.点击OK来关闭窗口。

新的电子表格会显示在布局上。

6.点击并拖动电子表格边框进行重新定位。
7.当电子表格放置在需要的位置时,释放按钮。

对于此练习,我们将在以下信息使用填充电子表格:

Column (列)A -抗体加入量,

Column(列) B -CD64中位荧光强度的单核细胞群体,和

Column(列) C -CD64中位荧光强度的淋巴细胞群体。

8.左击电子表格上的单元格A1
9.键入"Ab Added"(添加Ab)
10.按下Enter键。单元格A2将以蓝色概述(图T17.3)。
Figure T17.3 - Populating cell A1 of spreadsheet

Figure T17.3 - Populating cell A1 of spreadsheet

11.键入 "0.156"。
12.按下Enter键。单元格A3将以蓝色概述。
13.键入 "0.313"。
14.按下Enter键。单元格A4将以蓝色概述。
15.键入 "0.625"。
16.按下Enter键。单元格A5将以蓝色概述。
17.键入 "1.25"。
18.按下Enter键。单元格A6将以蓝色概述。
19.键入 "2.5"。
20.按下Enter键。单元格A7将以蓝色概述。
21.键入 "5"。
22.按下Enter键。单元格A8将以蓝色概述。
23.键入 "10"。
24.按下Enter键。单元格A9将以蓝色概述。

单元格A2-8应该用抗体量填充(图T17.4)。

Figure T17.4 - Column A populated properly

Figure T17.4 - Column A populated properly

要从列B填充单元格,我们将拖放SS Lin vs FL8 Log Color Dot(彩色点状)图到各个抗体量。

25.键入"Monos Median"(单核中位数)。
26.按下Enter键。单元格B2将以蓝色概述。
27.点击图0.156 ul CD64,
28.点击图边缘到电子表格单元格B2(图T17.5)。
Figure T17.5 - Drag and Drop Plot to cell B2 of spreadsheet

Figure T17.5 - Drag and Drop Plot to cell B2 of spreadsheet

29.放开鼠标键。
30.选择Statistic token(统计标记)Paste Special(选择性粘贴)窗口(图T17.6)。
Figure T17.6 - Paste Special window to insert Statistic token

Figure T17.6 - Paste Special window to insert Statistic token

Statistic(统计)页面将会出现(图T17.7)。

Figure T17.7 - Edit Statistic information for Monos

Figure T17.7 - Edit Statistic information for Monos

31.点击OK。
32.选择Monos(单核细胞)Select Gate(选择门)下拉菜单中。
33.选择Y Median(Y轴中值)Statistics(统计)列表框中。
34.选择OK.
35.重复步骤 27 - 34对以下颜色点图和电子表格单元格:

0.313 ul CD64B3,0.625 ul CD64B4,1.25 ul CD64B5,2.5 ul CD64B6,5 ul CD64B7

10 ul CD64B8.

电子表格应该如图T17.8所示。

Figure T17.8 - Columns A and B populated properly

Figure T17.8 - Columns A and B populated properly

列C通过将数据文件从数据列表拖放到电子表格上进行填充。

36.点击Data(数据)标签→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。
37.按下CTRL+A键以选择所有数据文件。
38.在数据列表中的任何数据文件上单击并按住鼠标。
39.拖拽数据文件到电子表格的单元格C1(图T17.9)。
Figure T17.9 - Drag and Drop Files from Data List to spreadsheet

Figure T17.9 - Drag and Drop Files from Data List to spreadsheet

40.放开鼠标键。

 

Statistic(统计)选项将会出现。

 

41.选择FL 8 LogData File Information(数据文件信息)下的Parameter(参数)下拉.
42.选择“Lymphs“Select Gate(选择门)下拉菜单中。
43.选择Median(中值)Statistic(统计)列表框中。
44.点击OK(图T17.10)。
Figure T17.10 - Edit Statistic window for Lymphs

Figure T17.10 - Edit Statistic window for Lymphs

45.点击单元格C1.
46.键入"Lymphs Median"。
47.按下Enter键。

电子表格应该类似于下面的图T17.11。

 

Figure T17.11 - Columns A, B, and C populated properly

Figure T17.11 - Columns A, B, and C populated properly

 

 

或者,门可以从每个点图被拖放到电子表格。

点击感兴趣的门,并放到适当的单元格上。
o例如,单击并拖动紫色Monos门从彩色点图-0.156 ul CD64 SS Lin vs FL 8 Log到电子表格的单元格B2
放开鼠标键。
选择Y Median(Y轴中值)Statistic(统计)列表框中。
点击OK.

门被更改时,电子表格中的值将会实时更新。

点击并按住布局上的图左上方红色Scatter(散点)门-10 ul CD64 SS Lin vs FS Lin.
移动鼠标并观察电子表格中更改的值,当Scatter(散点)门移动时。
放开鼠标键。
按下Ctrl+Z,撤销对门的修改。

要调整列宽度,请按照以下两个命令之一:

将鼠标光标悬停在列标题的右边界上,直到调整大小光标出现(Resizingcolumnarrow)双击(图T17.13下左侧)。
Spreadsheet(电子表格)标签组布局标签Format(格式)下拉菜单AutoFit Column Width(自动条整改列宽)(在图T17.12下右侧)。
Figure T17.12 - Resizing single column width (left) or autofitting widths for entire spreadsheet (right)

Figure T17.12 - Resizing single column width (left) or autofitting widths for entire spreadsheet (right)

我们现在将计算电子表格中单核细胞和淋巴细胞群体CD64染色的比例。

48.通过使用Insert(插入)→New Page (新页面)命令。
49.使用 View(查看)→Navigators(导航器)→Layout Navigator(布局导航器)命令来打开Layout Navigator(版面导航器).
50.将布局导航器中的电子表格“滴定”从第1页拖放到第2页(图T17.13)。

 

Figure T17.13 - Moving Spreadsheet to Page 2

Figure T17.13 - Moving Spreadsheet to Page 2

 

51.请选择View(视图)→Multiple Pages(多重页面)→Two Pages (Vertical)(纵向双页)命令。
52.转到第2页的布局。
53.选择电子表格。
54.点击单元格D1.
55.键入 "M/L Ratio"。
56.按下Enter键。键入 "="到单元格D2.
57.点击单元格B2
58.键入 "/"。
59.点击单元格C2。
60.按下Enter键。
61.点击单元格D2.
62.按住Shift并点击单元格D8.
63.放开鼠标键。
64. Ctrl+C.
65. Ctrl+D.

电子表格现在应该类似于图T17.14。

 

Figure T17.14 - Columns A, B, C, and D properly populated

Figure T17.14 - Columns A, B, C, and D properly populated