在本例中,我们将:

学习如何设置面板。
学习如何设置一个用来分析的实验文件列表。

 

本教程中,我们将分析2个样本,每个样本包含2个样本管组。这一面板将由两个复孔组成的样本管组组成,

我们将从定义面板开始,然后设置文件列表。

1.请打开一个新的空白版面。
2.请选择Batch(批处理)→Organize Data Sets(组织数据集)→Panels(面板)命令(图T10.1)。或者,选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Panels(面板)命令按钮来查看FCS的文本头信息。

 

Figure T10.1  Selecting the Panels Command

Figure T10.1  Selecting the Panels Command

 

多色盘信息对话框将出现,如图T10.2所示。

 

Figure T10.2  Panel Information Dialog

Figure T10.2  Panel Information Dialog

 

3.点击Add(添加)按钮(图T10.2)。

Add Panel(添加面板)对话框将出现,如图T10.3A所示。

4.进入My Panel(我的面板)。" in thePanel Name(面板名称)域。number1
5.请点击Number of Tubes(试管数目)数字调控按钮上向上的箭头,直到该字段变成2这时对话框看起来应该如图T10.3B所示。number2
6.名称列,将Tube #1命名为"T cell markers(T细胞标识)"和Tube #2 命名为"B cell markers(B细胞标识)",此时对话框看起来应如图T10.3C所示。number3
7.点击OK,来关闭Add Panel(添加面板)对话框。number4

 

Figure T10.3  Setting up a Panel using the Add Panel Dialog

Figure T10.3  Setting up a Panel using the Add Panel Dialog

 

面板信息对话框含有更新过的、新加的面板信息,如图T10.4所示。

 

Figure T10.4  Updated Panel Information Dialog

Figure T10.4  Updated Panel Information Dialog

 

8.点击OK,来关闭面板信息对话框(图T10.4)。

下一步包括使用Data List(数据列表)来设置我们想要使用面板进行分析的文件列表。

9.请选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令(图T10.5).或者,选择Batch(批处理)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令来查看FCS的文本头信息。

 

Figure T10.5  Selecting the Data List Command

Figure T10.5  Selecting the Data List Command

 

、一个Data List(数据列表)窗口将打开,如图T10.6所示。

 

Figure T10.6  Data List Window

Figure T10.6  Data List Window

 

10.点击Add(添加) NewAdd顶端的Data List(数据列表)按钮来添加文件。

Select a Data File(选择一数据文件)对话框打开(图T10.7)。

11.导航教程示例数据文件夹就在那里 GFPcontrol.001文件夹中。
12.选择Normal2_Tube1、Normal2_Tube2、Normal3_Tube1和Normal3_Tube2这四个文件,如图T10.7所示。要同时选择多个文件的话,就按Ctrl然后选择点击每个文件Normal2_Tube1按下Shift键不放,再点击最后一个文件Normal3_Tube2.)
13.点击Open(打开)(图T10.7)。

 

Figure T10.7  Selecting Data Files to insert into the Data List.

Figure T10.7  Selecting Data Files to insert into the Data List.

 

Data List(数据列表)现在,窗口列出选择的数据文件,每个数据文件都有重复的数number,每个panel中的管数和列出的File name(文件名)displayed.此Data List(数据列表)如图T10.8.所显示的那样

 

Figure T10.8  Updated Data List with Corresponding Tubes for the Panel

Figure T10.8  Updated Data List with Corresponding Tubes for the Panel

 

在图T10.8中,Data List(数据列表)窗口会显示您创建于左边列的试管和您添加到右边列的文件。这种方式会非常好地帮助用户把文件和相关试管组织起来,以备将来分析所用。如要进一步帮助组织数据文件,FCS Express可以让用户把FCS文件中的关键字添加到文件列表所显示的信息中。关键字是样本鉴定的描述性指标,可被添加到数据列表中,来轻松识别哪个数据文件与数据列表中的各个项目相对应。有很多关键字都可被用来在数据列表中识别数据文件。本教程中,我们将添加“$SRC”,将数据文件添加到数据列表中.

14.点击数据列表中的一个样本,将其选中。
15.点击Format(格式化)按钮显示顶端的Data List(数据列表)如图T10.8所示。

Format File List(格式文件列表)对话框将出现,如图T10.9所示。

16.选择Add(添加)Format Data List(数据列表)对话框。

 

Figure T10.9  Format File List Dialog

Figure T10.9  Format File List Dialog

 

 

Please select one or more keywords(请选择一个或多个关键字)对话框将出现,如图T10.10所示。在此我们将选择“$SRC”关键字,来显示在Data List(数据列表).

17.请点击滑动条向下的箭头来到列表的底部。
18.点击“$SRC”将其选中,如图T10.10所示。如果想要显示多个关键字,您可以通过按下Shift键来选中多个相邻的关键字;或者在点击每个关键字的同时,按下Ctrl键,来选择多个不相邻的关键字。在本例中,我们仅仅选择“$SRC”.
19.点击OK(图T10.10).

 

Figure T10.10  Selecting an FCS Keyword to use in the Data List

Figure T10.10  Selecting an FCS Keyword to use in the Data List

 

Format File List(格式文件列表)对话框将被“$SRC”更新选择关键字的文件夹中,如图T10.12所示。数据列表也可被格式化以分组的形式显示您的数据。

20.选择OKon theFormat File List(格式文件列表)对话框。

Data List(数据列表)对话框将进行更新,来显示数据文件的分组情况,且显示的文件名中不带有完全路径,而带有“$SRC”这个关键词,如图T10.13所示。

 

Figure T10.13  Data List Window Updated with Groups, File Names and $SRC Column.

Figure T10.13  Data List Window Updated with Groups, File Names and $SRC Column.

 

用户可以使用Data List(数据列表)对话框顶端方的图标(如图e T10.13)来操纵列表中的数据文件。

如前面演示的那样,用户可以点选添加键来添加更多的数据文件,NewAdd也可以点击Format (格式)按钮来添加更多的关键字。NewFormat要在Data List(数据列表)中上下移动文件,请选择向上NewUp或向下NewDown箭头。要更改一文件,请选择Change File(更改文件)按钮,NewChangeFile要查找文件,请点选Search(查找)按钮。NewSearch要从列表中删除一个文件,请将该文件选中,然后点击Delete(删除)按钮NewDelete.

在FCS Express第四版中,如果数据列表中的试管的顺序做了任何更改,显示这些数据文件的绘图的位置也会自动更改。如果你的文件很大,当数据列表中的每个试管都向上或者向下移动时,版面可能需要一定时间来进行更新。

但是,在FCS Express 6中,用户可以将这样的更新推迟,直到将文件都移动到你想要的位置.点击Defer Layout Changes(推迟版面更改)图表,DeferLayoutChangesIcon用户可以对试管的顺序做更改,然后取消对这一图标的选择,分析版面中的数据就将自动更新。