创建门
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创建门最方便的方法是使用Home(主页)标签卡和Gating(门操作)标签卡里Create Gates(创建门)命令组中的命令。另外,除了标识(一维)以外,所有其它的门均可通过在二维绘图的弹出菜单上选择Create Gate(创建门)命令来创建(右键点击绘图来调出弹出菜单)。
在本章中,我们会:
• | 打开一个以前创建的版面。 |
• | 创建矩形门、椭圆形门、多边形门以及自由形门。 |
• | 修改数据文件。 |
• | 在二维绘图上创建一维门。 |
• | 从标识创建一维门。 |
• | 把象限转化为门。 |
用户在跟着本教程练习过程中可以使用自己的数据,也可以使用本教程提供的样本数据。样本数据文件可在教程样本数据库里找到。这里我们会使用section5.fey版面文件以及ApoMono.001和ApoMono.002两个数据文件。
要打开一个版面:
1. | 请选择Application Button(应用程序按钮)→Open Layout(打开版面)。 |
2. | 请打开位于教程样本数据库中的section5.fey版面。 |
3. | 请选择Home(主页)→Editing(编辑)→Select All(选中所有)命令。 |
4. | 请选择Data(数据)→Change Data on Selection(修改选中的数据)→Select(选中)命令。 |
5. | 请选中FCS Express Sample Data(FCS Express样本数据 )目录中的ApoMono.001文件。 |
门通常是使用Gating(门操作)标签卡来创建的。这些门操作命令请见图T4.1,对它们的解释见下边的表格。门操作命令也可在Home(主页)标签卡中找到。在以后的内容中,我们将介绍如何对从多孔细胞板里获取的数据进行门操作。
图T4.1 Gating Commands (门操作命令)
图标 |
解释 |
插入椭圆形门 |
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插入矩形门 |
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插入多边形门 |
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插入自由形门 |
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插入标识 |
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插入象限 |
如果把鼠标移动到Create Gates(创建门)命令组中的命令上方,系统便会显示一个关于该命令的提示信息。
要查看门操作命令提示信息(图T4.2):
1. | 请移动光标,使其处于Rectangle(矩形门) 按钮上方。 |
2. | 保持鼠标半秒钟不动。 |
图T4.2 Gating Command Hint (门操作命令提示)
下面我们将在版面绘图中插入四种不同类型的门。
要创建矩形门:
1. | 请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Rectangle(矩形门)命令。命令被选中时,按钮会有一个不同的颜色背景![]() |
我们会在密度图上(图T4.3)的提示语"Create the rectangular gate on this plot(在该绘图上创建矩形门)"下方来创建一个矩形门。
图T4.3 Density Plot for First Gating Excercise (第一次创建门时使用的密度图)
2. | 请把鼠标移动到用户希望矩形门左上角出现的位置。 |
3. | 按下鼠标左键不放。 |
4. | 把光标拖动到门的右下角将要出现的地方(图T4.4)。 |
图T4.4 Creating Rectangular Gate (创建矩形门)
5. | 放开鼠标键。 |
这时会出现Create New Gate(创建新门)对话框(图T4.5)。请为此新门取个名称。
图T4.5 Create New Gate Dialog (创建新门对话框)
6. | 请在Create a new gate named(创建一个新门,其名称是)文本字段输入"Whole Cells(所有细胞)"。 |
7. | 点击OK来应用该名称。 |
这时该门和显示其名称的文本框会出现在绘图上(图T4.6)。
图T4.6 Newly Created Rectangular Gate (新创建的矩形门)
注: 按下键盘上的ESC键,用户可以在创建门的任何一步中(2到5步)取消创建门的操作。该方法可应用于所有类型的门。
要创建椭圆形门:
1. | 请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Ellipse(椭圆形门)命令。命令被选中时,按钮会有一个不同的颜色背景![]() |
我们会把椭圆形门创建在绘图上写有"Create the elliptical gate on this plot(在此绘图上创建椭圆形门)"的文本下方。
2. | 请跟着上面的2-5步来创建一个椭圆形门。 |
3. | 请在Create a new gate named(创建一个新门,其名称是)文本字段中输入"Cells in ellipse(椭圆形中的细胞)"。 |
4. | 请点击OK键来应用这个名称。 |
要创建多边形门:
我们会在绘图上写有"Create the polygon gate on this plot(在该绘图上创建多边形门)"的下方创建一个多边形门。
1. | 请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Polygon(多边形门)命令。命令被选中时,按钮会呈现出一个不同的颜色背景![]() |
2. | 请把鼠标移动到门的起始点。 |
3. | 点击鼠标,开始画多边形门。这时会出现一个黑色的正方形,表明已经创建了第一个自由形的顶点。 |
4. | 请把鼠标移动到另一个想要创建的门的顶点处。在鼠标移动过程中会出现一条跟着鼠标的线。 |
5. | 请在新顶点的位置点击鼠标键。 |
6. | 请重复第4-5步,直到你想要关闭该多边形为止。 |
7. | 请点击第一个顶点的黑色正方形,来关闭该多边形(图T4.7)。或者,用户可以按下空格键来关闭该多边形。 |
图T4.7 Polygon Gate (多边形门)
这时会弹出一个Create New Gate(创建新门)对话框,类似于图T4.5。我们现在可以给门起一个名称:
8. | 请在Create a new gate named(创建一个新门,其名称是)文本字段输入"Cells in a polygon(多边形中的细胞)"。 |
9. | 请点击OK键,来应用该名称。 |
要创建自由形门:
1. | 请选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Freeform(自由形门)命令。命令被选中时,按钮会呈现出一个不同的颜色背景![]() |
2. | 请把光标移动到想要开始创建自由形门的位置。 |
3. | 按下鼠标左键不放。 |
4. | 请移动鼠标来画出想要的形状,在移动过程中请不要松开鼠标。会有一条线跟着光标,提示门会在哪儿出现。 |
5. | 请松开鼠标来创建该门(图T4.8)。 |
图T4.8 Freeform Gate (自由形门)
这时会跳出一个Create New Gate(创建新门)对话框,和图T4.5很类似。我们现在可以给门起一个名称:
6. | 请在Create a new gate named(创建一个新门,其名称是)字段中输入"Cells in freeform(在自由形门中的细胞)"。 |
7. | 请点击OK键来应用该名称。 |
在下一节中,我们将在二维绘图上创建一个一维门。