格式化细胞分裂柱状图

在本节中，我们将:

•	学习如何为细胞分裂曲线加上不同的颜色，以更好地查看用户感兴趣的细胞群。

•	学习如何创建曲线拟合统计。

•	学习如何对细胞分裂柱状图做平滑处理。

1.	请在细胞分裂柱状图上点击，将其选中。

2.	请选中Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Overlays(叠加图层)命令。

这时会出现Formatting Overlays (格式化叠加图层)对话框(图T20.22)。

3.	请从左边选中Undivided Cells(未分裂的细胞)叠加图层(图T20.22)。

4.	请从Color(颜色)下拉列表中选中Blue(蓝色)。

5.	请从Fill Style(填充样式)下拉列表中选中第一个选项，一个完全填充的矩形。

请点击OK。

图T20.22 Formatting Overlays Dialog (格式化叠加图层对话框)

这时会出现细胞分裂柱状图，其中蓝色的信号峰代表未分裂的细胞(图T20.23)。这让用户可以很容易地确认拟合峰的正确位置。用户可以通过这种方式修改一个或所有的拟合元素。

图T20.23 Proliferation Histogram Formatted to Show Undivided Cells in Blue (格式化的细胞分裂柱状图显示蓝色的未分裂细胞)

RMS error(均方根误差)以及R-Chi Square(R-卡方)是两个衡量拟合好坏的统计数据。在设置细胞分裂拟合参数时，注意一下参数修改如何影响这两个统计数据是非常重要的。从数学理论上说，能够使得RMS error(均方根误差)以及R-Chi Square(R-卡方)最小的设置组合是最好的拟合。我们现在来演示一下和细胞分裂模型相关的统计。

7.	请右键点击细胞分裂柱状图，调出相关弹出菜单。

8.	请从弹出菜单上选中Statistics(统计)→Proliferation Fit Statistics(细胞分裂拟合统计)。

这时会出现Proliferation Fit Statistics(细胞分裂拟合统计)窗口。

9.	请右键点击细胞分裂柱状图，调出相关弹出菜单。

10.	请选中Statistics(统计)→Proliferation Population Statistics(细胞分裂细胞群统计)。

这时会出现Proliferation Population Statistics(细胞分裂细胞群统计)窗口。

11.	请移动一下这两个统计窗口，让细胞分裂柱状图处于可见状态(图T20.24)。

图T20.24 Proliferation Histogram with the Proliferation Fit Statistics and Population Statistics (细胞分裂柱状图以及细胞分裂拟合统计和细胞群统计)

我们现在要来把细胞分裂柱状图进行平滑处理。

12.	请点击细胞分裂柱状图，将其激活。

13.	请选中 Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Overlays(叠加图层)命令。

这时会出现Formatting Overlays(格式化叠加图层)对话框，如图T20.22所示。

注意到，在默认情况下，左手边的第一个叠加图层处于选中状态。这将是我们要进行平滑处理的叠加图层，因为其它的叠加图层都是从拟合算法中计算出来的。

14.	请把Smoothing(平滑度)增加到2。

15.

请点击OK。

这时细胞分裂柱状图以及统计数据已经进行了更新，来显示这个平滑处理(图T20.25)。黑色的原始数据轮廓线平滑了很多，但是拟合曲线基本没变。尽管这一处理给出了一个更好的视觉呈现，但这一功能要谨慎使用，因为它会影响使用原始数据获得的统计数据，因而进一步影响对数据的表述。

图T20.25 Proliferation Histogram and Associated Statistics with Smoothing (细胞分裂柱状图以及和平滑处理相关的统计)

Help URL: http://www.yourdomain.com/help/index.html?formatting_a_proliferation_hi2.htm