在有大量数据输出的实验室，流式细胞仪检测和细胞成像通常是在96孔微孔板上进行的。从96孔微孔板上获取的数据一般包含96个独立的数据文件。FCS Express会自动合并所有文件到一个数据集中，然后将每个"细胞"和它所在的细胞孔进行关联。

 

Heat Map(热图)用一个和细胞板一样的网格来呈现用户数据，网格上每个孔根据显示的统计数据而带有不同的颜色。通过选择相应的配色方案和统计显示，用户可对实验有一个基本印象。通过比较每个细胞孔里的统计数据和微孔板上的整体数据，用户可快速看到那些偏离很大的细胞孔。

 

Picture Plots(图像绘图)显示二维细胞(或其它物体的)形态。可将其考虑为带有门的细胞图像集合。细胞的位置显示在由x-和y-轴构成的绘图上。门可应用于单个细胞或细胞组。