FCS Express 4用户手册

插入并且格式化图像绘图

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在这一节中,我们将学习如何:

为查看图像绘图进行相关设置
选择要显示的通道
创建多通道叠加图层以创建合并图像

 

1.请打开一个新版面。
2.请选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。
3.请从教程样本数据库中把pictureplotsample1.dns和pictureplotsample2.dns文件添加到Data List(数据列表)中。
4.请把pictureplotsample1.dns文件从Data List(数据列表)中拖放到版面上。
5.请点击Picture Plot(图像绘图)并且保证其它复选框未被选中(图T26.1)。

 

图T26.1  Choosing to Insert a Picture Plot (选择插入图像绘图)

图T26.1  Choosing to Insert a Picture Plot (选择插入图像绘图)

 

6.请点击OK

这时在版面上会出现一个图像绘图,如图T26.2所示。我们现在来修改一下“查看背景选项”,以便仅仅显示单个细胞的蒙版,而不显示图像背景。

注: 数轴上的刻度数值反映了像素坐标。你现在可以通过修改数轴格式化选项把这些刻度数值关掉。

 

图T26.2  Picture Plot for pictureplotsample1.dns Inserted in the Layout (插入到版面中的pictureplotsample1.dns文件对应的图像绘图)

图T26.2  Picture Plot for pictureplotsample1.dns Inserted in the Layout (插入到版面中的pictureplotsample1.dns文件对应的图像绘图)

 

7. 请右键点击图像绘图。
8. 请从弹出菜单上选择Format(格式)
9. 请选择Overlays(叠加图层)类别选项。
10. 请取消对Show Background Image(显示背景图像)的勾选(图T26.3)。

 

图T26.3  Deselecting the Show Background Images Option (取消显示背景图像的选择)

图T26.3  Deselecting the Show Background Images Option (取消显示背景图像的选择)

 

11. 请点击Preview(预览)

请把格式化窗口移到旁边,这样你可以看到图像绘图。注意到黑色的背景已经被拿掉了,屏幕上仅仅显示单个的细胞(图T26.4)。

 

图T26.4  Before (Left) and After (Right) Removing the Background Image (移除背景图像前(左图)与移除背景图像后(右图)比较)

图T26.4  Before (Left) and After (Right) Removing the Background Image (移除背景图像前(左图)与移除背景图像后(右图)比较)

 

我们现在来看一下图像的另外一个通道,然后创建一个两通道合并图像。

12. 请点击Cancel(取消),回到有背景的图像。
13. 请把图像绘图复制和粘贴到版面中任意位置。
14. 请在新绘图的名称上点击并按住不放(图T26.5)。

 

图T26.5  Choosing the DNA Imaging Channel (选择DNA图像通道)

图T26.5  Choosing the DNA Imaging Channel (选择DNA图像通道)

 

15. 请选择DNA以查看图像中的DNA通道(图T26.5)。

图像绘图现在看起来应该如图T26.6所示,显示和图像绘图相关的DNA图像。

 

图T26.6  The DNA Image Channel Associated with pictureplotsample1.dns (与pictureplotsample1.dns相关的DNA图像通道)

图T26.6  The DNA Image Channel Associated with pictureplotsample1.dns (与pictureplotsample1.dns相关的DNA图像通道)

 

16. 请把显示DNA通道的绘图拖放到显示细胞质通道的绘图上。
17. 请从Paste Special(特殊粘贴)对话框上选择2D Plot Overlay(s)(二维绘图叠加图层)
18. 请点击OK

这时的图像绘图看起来应该如图T26.7所示,DNA通道叠加到了细胞质通道上方,构成了一个合并图像。

 

图T26.7  Picture Plot Overlay Displaying the Cytoplasmic and DNA Channels as a Merged Image (把细胞质和DNA通道作为一个合并图像显示出来的图像绘图叠加图层)

图T26.7  Picture Plot Overlay Displaying the Cytoplasmic and DNA Channels as a Merged Image (把细胞质和DNA通道作为一个合并图像显示出来的图像绘图叠加图层)

 

就像FCS Express中的任何其它绘图一样,图像绘图中的数据可以使用Next(下一个)Previous(前一个)命令来进行翻动。我们现在就来使用这些命令来改变图像绘图中显示的图像。

19. 请点击新建的叠加图层,将其选中。
20. 请选择Data(数据)→Change Data on Selection(修改选中的数据)→Next(下一个)命令。

图像绘图将显示Data List(数据列表)中的下一个样本/图像。FCS Express可以处理彩色以及灰度图像(如与pictureplotsample2.dns相关的灰度绘图)。

 

在下一节中,我们将学习对图像绘图进行门操作