插入并且格式化图像绘图
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在这一节中,我们将学习如何:
• | 为查看图像绘图进行相关设置 |
• | 选择要显示的通道 |
• | 创建多通道叠加图层以创建合并图像 |
1. | 请打开一个新版面。 |
2. | 请选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。 |
3. | 请从教程样本数据库中把pictureplotsample1.dns和pictureplotsample2.dns文件添加到Data List(数据列表)中。 |
4. | 请把pictureplotsample1.dns文件从Data List(数据列表)中拖放到版面上。 |
5. | 请点击Picture Plot(图像绘图)并且保证其它复选框未被选中(图T26.1)。 |
图T26.1 Choosing to Insert a Picture Plot (选择插入图像绘图)
6. | 请点击OK。 |
这时在版面上会出现一个图像绘图,如图T26.2所示。我们现在来修改一下“查看背景选项”,以便仅仅显示单个细胞的蒙版,而不显示图像背景。
注: 数轴上的刻度数值反映了像素坐标。你现在可以通过修改数轴格式化选项把这些刻度数值关掉。
图T26.2 Picture Plot for pictureplotsample1.dns Inserted in the Layout (插入到版面中的pictureplotsample1.dns文件对应的图像绘图)
7. | 请右键点击图像绘图。 |
8. | 请从弹出菜单上选择Format(格式)。 |
9. | 请选择Overlays(叠加图层)类别选项。 |
10. | 请取消对Show Background Image(显示背景图像)的勾选(图T26.3)。 |
图T26.3 Deselecting the Show Background Images Option (取消显示背景图像的选择)
11. | 请点击Preview(预览)。 |
请把格式化窗口移到旁边,这样你可以看到图像绘图。注意到黑色的背景已经被拿掉了,屏幕上仅仅显示单个的细胞(图T26.4)。
图T26.4 Before (Left) and After (Right) Removing the Background Image (移除背景图像前(左图)与移除背景图像后(右图)比较)
我们现在来看一下图像的另外一个通道,然后创建一个两通道合并图像。
12. | 请点击Cancel(取消),回到有背景的图像。 |
13. | 请把图像绘图复制和粘贴到版面中任意位置。 |
14. | 请在新绘图的名称上点击并按住不放(图T26.5)。 |
图T26.5 Choosing the DNA Imaging Channel (选择DNA图像通道)
15. | 请选择DNA以查看图像中的DNA通道(图T26.5)。 |
图像绘图现在看起来应该如图T26.6所示,显示和图像绘图相关的DNA图像。
图T26.6 The DNA Image Channel Associated with pictureplotsample1.dns (与pictureplotsample1.dns相关的DNA图像通道)
16. | 请把显示DNA通道的绘图拖放到显示细胞质通道的绘图上。 |
17. | 请从Paste Special(特殊粘贴)对话框上选择2D Plot Overlay(s)(二维绘图叠加图层)。 |
18. | 请点击OK。 |
这时的图像绘图看起来应该如图T26.7所示,DNA通道叠加到了细胞质通道上方,构成了一个合并图像。
图T26.7 Picture Plot Overlay Displaying the Cytoplasmic and DNA Channels as a Merged Image (把细胞质和DNA通道作为一个合并图像显示出来的图像绘图叠加图层)
就像FCS Express中的任何其它绘图一样,图像绘图中的数据可以使用Next(下一个)和Previous(前一个)命令来进行翻动。我们现在就来使用这些命令来改变图像绘图中显示的图像。
19. | 请点击新建的叠加图层,将其选中。 |
20. | 请选择Data(数据)→Change Data on Selection(修改选中的数据)→Next(下一个)命令。 |
图像绘图将显示Data List(数据列表)中的下一个样本/图像。FCS Express可以处理彩色以及灰度图像(如与pictureplotsample2.dns相关的灰度绘图)。
在下一节中,我们将学习对图像绘图进行门操作。