使用参数数学
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在检测动力学数据过程中常常要来定义一个比值。这个比值可能是两个染色剂之间的比值,有可能是同一个染色剂在两个不同发射波长上的比值。FCS Express的参数数学功能可以让用户定义在分析中有可能用到的简单比率或者复杂的公式操作。FCS Express将可以计算和显示实际的比值,而非一些其它软件中用到的人为定义的成倍整数。
在这节中,我们将学习如何创建在动力学绘图中使用的参数数学公式。
在本教程学习过程中,用户可以使用自己的数据,也可以使用本教程提供的样本数据。样本数据文件可在教程样本数据库里找到。数据文件KineticsTutorial.fey、kinetics10.010以及kinetics25.025已经被嵌入到了将要在这里使用的版面中。
1. | 请选择Application Button(应用程序按钮)→Open Layout(打开版面)。 |
2. | 请从Load Layout(导入版面)对话框选中位于FCS Express样本数据目录中的KineticsTutorial.fey版面。 |
3. | 请选择Data(数据)→Calculate(计算)→Parameter Math(参数数学)→Sequence Setup(设置序列)(图T21.1)。 |
图T21.1 Selecting the Parameter Math Sequence Setup Command (选中参数数学序列设置命令)
4. | 请在Parameter Math Sequence(参数数学序列)对话框中选中New(新建)(图T21.2)来定义一个新的公式。 |
图T21.2 Choosing to Define a New Parameter Math Formula (定义新的参数数学公式)
以下步骤均针对图T21.3。
5. | 请在Output Parameter Name(输出参数名称)选框中输入Ca++ Ratio(钙离子比率)![]() |
6. | 请选中除法数学运算符"/![]() |
7. | 请把Second Input Parameter(第二个输入参数)改为FL3-H ![]() |
8. | 请点击OK ![]() |
图T21.3 Defining a Parameter Math Sequence Item Formula (定义参数数学序列公式)
这时的Parameter Math Sequence(参数数学序列)对话框将显示我们刚才定义的公式序列(图T21.4)。
图T21.4 Parameter Math Sequence Dialog with Formula Displayed (显示公式的参数数学序列对话框)
9. | 请点击OK。 |
10. | 请选择Data(数据)→Calculate(计算)→Parameter Math(参数数学)→Run Sequence(运行序列)→On All Files(应用到所有文件)命令来应用这个公式(图T21.5)。 |
图T21.5 Applying the Parameter Math Formula to All Files (把参数数学公式应用到所有文件上)
11. | 请在键盘上按下Ctrl+A,选中所有绘图。 |
12. | 请选择Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Overlays(叠加图层)命令。 |
13. | 请在Y-Parameter(Y-参数)的下拉列表中选中Ca++ Ratio(钙离子比率)(也就是参数数学定义的公式)(图T21.6)。 |
14. | 请点击OK。 |
图T21.6 Changing the Y Axis to the Ratio Defined by the Parameter Math (把Y轴参数改为由参数数学定义的比率)
版面上的绘图现在应该看起来如图T21.7所示。因为参数数学计算的第一个参数是对数参数,FCS Express会假定新创建的参数也应该是一个对数参数。这种假设在一般情况下是对的,但在本例子中并非如此。因为绘图显示实际的比率数值,我们需要来调整数值设置以在线性坐标系中显示数据。
图T21.7 Ca++ Ratio vs Time (钙离子比率与时间图)
15. | 请点击Ctrl+A,选中所有绘图。 |
16. | 请选中Format(格式)→Plot Options(绘图选项)→Axes(数轴)命令。 |
以下步骤均针对图T21.8。
17. | 请从左边的列表中选择Y-Axis(Y-轴)![]() |
18. | 请在Range(范围)![]() |
19. | 请把范围中的Minimum(最小值)设置为0 。 |
20. | 请把范围中的Maximum(最大值)设置为1 。 |
21. | 请在Scale(坐标系)![]() |
22. | 请从下拉列表中选择Linear(线性)![]() |
23. | 请点击OK。 |
图T21.8 Formatting Axes Dialog (格式化数轴对话框)
这时版面中的绘图应该看起来如图T21.9所示。
图T21.9 Plots Scaled Correctly to Display the Ca++ Ratio (正确调整了坐标系的绘图显示Ca++比率)
在下一节中,我们将为动力学绘图应用门操作以及统计计算。