创建一.ijx分析配置文件

简介:

当图像属于一个集合或者一个组群,用户必须创建一带有.ijx扩展名的分析配置文件。分析配置文件(.ijx文件)将允许ImageJ来决定相关联的图像间有何不同。例如,如果来自一单一视野的两个图像代表通道1和通道2,或者如果96个分开的图像组成基于实验的96孔细胞盘。可代表.ijx文件的可能数据的一个完整列表和使用案例,可在DNS 宏示例概述中找到

 

我们将使用宏和图像,它们来自 教程样本数据库,位于 ImageJ教程文件夹中。. 下面的文件和文件夹将被用来在教程中创建分析配置文件:

 

DNS-IJXwriter.xlsm Excel宏
DNSAnalysisCreator.ijm宏
在多通道图像实验文件夹中找到的图像

 

数据集的图像代表2个颜色(2个通道)成像实验,这一实验是用DAPI进行核染色,用FITC进行细胞质蛋白染色。

 

 

我们将从DNS-IJXwriter.xlsm Exce宏*中创建一.ijx文件,来开始本教程(点击下面来继续)。

 

DNS-IJXwriter.xlsm,一个宏-激活的Excel文件,用来自动读取您的文件名和创建一 .ijx文件 (推荐)

 

 

或者来到使用DNS分析创造者创建一.ijx文件部分:

 

DNSAnalysisCreator.ijm,设计一个宏来在创建分析配置文件时帮助用户

 

注意: 本教程的焦点不是如何创建宏或者使用ImageJ,而是如何使用De Novo Software提供的宏。 要了解更多的关于ImageJ的信息,请查看 ImageJ网站 http://rsbweb.nih.gov/ij/index.html 或者写信给厂家帮助和信息 ImageJ 邮件列表

 

*DNS-IJXwriter.xlsm Excel 宏,由 Peter Haub著作

 

下一节, 我们将使用DNS-IJXwriter.xlsm 宏-激活的Excel文件,来自动创建一.ijx分析配置文件。