ImageJ是一款免费的开放源代码的文件,用来处理和分析图像。通过使用宏和插件,用户可以自动分派和创建用户工具。De Novo Software已经为ImageJ创建了宏和插件,允许用户从ImageJ中将成像实验以多种形式输出到FCS Express第5版中(请参见具体实例的网页介绍)。您的数据一旦从ImageJ中输出,FCS Express 5 Image Cytometry软件允许用我们熟悉的二维绘图和新绘图类型(例如图像绘图和热图),来显示您的数据。

 

本教程将使用样本数据来:

从ImageJ中输出一单个图像到FCS Express中
创建一.ijx分析配置文件
使用一.ijx分析配置文件从ImageJ中输出一组或一套图像到FCS Express中

 

关于De Novo Software ImageJ宏的总该和详细介绍,请参见以下链接:

General workflow for exporting ImageJ data to FCS Express(从ImageJ中输出到FCS Express中流程概述)
ImageJ Macros for FCS Express General Overview(用于FCS Express的ImageJ宏概述)
Overview for the DNSMacroExample.ijm macro used to export data from ImageJ to FCS Express(用来从ImageJ中输出数据到FCS Express中的DNSMacroExample.ijm宏概述)
Overview for the DNSAnalysisCreator.ijm macro to create an .ijx Analysis Configuration File(用来创建.ijx分析配置文件的DNSAnalysisCreator.ijm宏概述)
ImageJ for FCS Express Knowledge Base(FCS Express的ImageJ知识库)

 

注意: 本章节关注的焦点不在于如何创建宏或者使用ImageJ,而是在于De Novo Software提供的宏。要详细了解ImageJ,请参见ImageJ网站(http://rsbweb.nih.gov/ij/index.html)或者写邮件给ImageJ团队