DNS Analysis Creator Macro(DNS分析创造宏)创建了一个*.ijx分析配置文件,ImageJ可用该分析配置文件对集合中的图像进行排序、组群和加工,详细介绍请见“DNS宏案例概述”

 

 

该分析配置文件是一个逗号分隔值(.csv)文本文件,带有一.ijx扩展。文件的第一行必须包含一列数据头。例如:文件名称,通道。

 

.ijx文件中有效的列数据头:

 

Filename(文件名):它必须是第一个字段,必须有完整的限定路径到文件中,包括完整的路径。它不能是空着的。例如,c:\image data\img004.jpg。

 

Channel(通道):(自选操作)如果存在,那它就是第二个字段。它不能是空着的。例如,它可以是:绿色。通道的名称,用户可以按照自己喜好来命名,但必须在不同的微孔或视野间进行重复。

 

Well(微孔):(自选操作)如果存在,那它就是第三个字段。它不能是空着的。它的格式是1个或者2个字母(a..z或A..Z范围),后面跟着最多4个数字(0..9范围)。例如,它可以是B07。

 

FOV_row(视野_行):(自选操作) 它是一个拼贴图像中field of view(视野)的行数或者拼贴/缝合的位置。根据您的说明书,视野会在一个网格中重新组装。如果存在“Well(微孔)”,那它就在第四个字段;如果“Well(微孔)”不存在,那它就在第三个字段。它不能是空着的。它必须是一个整数,表明field of view(视野)的行数,从0开始。例如,0

 

FOV_col(视野_列):(自选操作) 它是一个拼贴图像中field of view(视野)的列数或者拼贴/缝合的位置。根据您的说明书,视野会在一个网格中重新组装。如果存在“Well(微孔)”,那它就在第屋个字段;如果“Well(微孔)”不存在,那它就在第四个字段。它不能是空着的。如果FOV_row(视野_行)存在,那么FOV_col(视野_列)也会存在。它必须是一个整数,表明field of view(视野)的列数,从0开始。例如,2

 

下面是文件头的例子:

Filename(文件名)

Filename(文件名),Channel(通道)

Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔)

Filename(文件名),Channel(通道),FOV_row(视野_行),FOV_col(视野_列)

Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔),FOV_row(视野_行),FOV_col(视野_列)

 

附加注意事项:

a.图像文件名称中至少有一列带有全路径。如果存在随后的列,那所有的介入列也必须存在。例如,如果您选择Filename(文件名)Well(微孔)那您必须还具有一个Channel(通道)列存在,最后的结果会是Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔)
b.数据头关键字有大小写之分。
c.该字段处没有默认值。这意味着两个连续的分隔符,是不允许的。

 

 

如何创建一个.lJX文件。

 

分析配置文件(*.IJX文件)可通过以下方式创建:

 

使用DNS分析创造宏
利用Excel基础宏,在Excel中使用DNS IJX作者
ImageJ或者Excel中手动编辑.IJX文件

 

 

在下一节中,我们将完成一个.ijx分析配置文件的创建