ImageJ可以直接编辑一个由DNS Analysis Creator Macro(DNS分析创造宏)创建的.IJX文件。
1. | 点击File(文件)→Open in ImageJ(在ImageJ中打开)。 |
2. | 导航到Tutorial Sample Data(教程样本数据)文件夹→Multichannel Image Experiment(多通道图像实验)文件夹→ImageJ Tutorial(ImageJ教程)文件夹。 |
3. | 请双击FileListForDnsExporter.ijx文件,将其打开。 |
此FileListForDnsExporter.ijx文件将在ImageJ文本编辑器中打开,如下图T28.108所示。自动创建的默认文件为所有可能的情境创建列表头和带有位置标题的行(表示文本在小于和等于符号/括号之间,<WellID>)为这些信息。您会注意到,在第6行(在底部)中,如果需要,会包括基于板子实验的信息。我们现在要对文件进行编辑,让它只包含文件名和通道的列表头,每行中只有相关的通道信息。
Figure T28.108 The FileListForDnsExporter.ijx file opened in ImageJ that was created in the previous steps.
4. | 在第1行中删除Well(微孔)、FOV_row(视野_行)和FOV_col(视野_列)列。 |
5. | 在最后一行中删除#Plate Info(板子信息)、Rows(行)、<rows>、Columns(列)、<cols>信息。 |
6. | 删除所有<WellID>、<FOV_row>和<FOV_col>实例。 |
7. | 用来自图片名称的各自通道名来替代每行中的<Channel_Name>文本。 |
例如:在第2行中的图像名称是Image1DAPI.jpg。在本例中,用DAPI来取代<Channel_Name>文本。 同样,在交替行中用FITC取代<Channel_Name>。
当您完成对FileListForDnsExporter.ijx文件的编辑,它现在应如下图T28.109所示。
Figure T28.109 The FilelistForDnsExpoter.ijx file in ImageJ after editing to remove extra column headers, plate information, and adding the channel information.
8. | 请点击ImageJ文本编辑器中的File(文件)→Save(保存)选项。 |
您现在就将来自两个图像实验的两个通道的分析配置文件进行了编辑和保存。
在下一节中,我们将使用新创建的.ijx文件来从ImageJ分析和输出结果到FCS Express中