可用数轴格式化选项来调整一绘图上的坐标系。所有数据文件，无论获取这些数据时的坐标是什么，均可在FCS Express中以任何坐标系形式显示。坐标系只改变数据的显示方式，不会改变统计计算。

 

线性/对数和超对数坐标系：

此线性/对数和超对数坐标系都有一个可调整的系数。此系数可在格式化对话框的Axis(坐标轴)页的Scale(缩放)部分进行更改(右键点击绘图，从弹出菜单选择Format(格式)选项)。此系数被称作Transition Point(过渡点)，因为它描述了从线性主导区到对数主导区的过渡。针对Hyperlog(超对数)坐标系的转换参数等于Bagwell paper中的b参数。

 

设置一个带有 200过渡点的线性/对数坐标系，如图9所示。28键入的过渡值是以通道为单位，不必像Bagwellpaper中描述的那样选择数值。

 

 

 

 

 

对所有这些过渡值而言，较小的过渡值会让绘图更真实地模拟标准对数图。精确过渡值的选取在很大程度上取决于用户的数据，一般来说，该值最少要是30。

 

双指数缩放：

双指数体系被BD FACSDiva软件普及化。因为我们和BD的密切合作，FCS Express现在支持FACSDiva在显示双指数数据方面的所有选项。实际上，我们引入了FACSDiva的计算过渡点值(零以下)的专有算法，因此FCS Express的结果看起来和FACSDiva软件的结果完全一样。

 

当一个用BD FACSDiva软件获得的FCS文本在FCS Express中打开时，您将会注意到FCS Express中的自动定比应用了双指数缩放和自动选择Below Zero Parameter(零以下参数)(过渡点)(图9)29)。

 

 

此Below Zero Parameter(零以下参数)可手动调整，方法是不选中Automatic(自动)复选，然后选择Use the value(使用该值)单选按钮。通过选中/取消选中相关的复选框，您同样可以决定是否自动设置绘图的最小值。当Automatically set the plot's minimum value(自动设置绘图的最小值)复选框被选中，过渡点设置为不显示离群值的最优展示。当不选中整个数据范围，包括离群值时，离群值就会展示在过渡点中(图930)。

 

 

此Calculate automatically(自动计算)单选按钮可以被选中，如果您想要对计算的门进行更改的话(图931)或者您想要将计算方法更改为第五百分位(图9)。32)用第五百分位方法设置绘图最小值后，选中门中底部的５％的数据就不会显示。

 

反双曲正弦坐标系：

ArcSinh(反双曲正弦) 的反双曲函数广泛应用于CyTOF质谱流式细胞术产生的.fcs文件中。与来自流式细胞仪的标准光不同，质谱流式细胞术可以产生很多真正的零信号值(“强度”)。反双曲正弦转换让零值或接近零的值可显示和形象化，就如我们通常可视化流式细胞仪数据一样。通过将反双曲正弦方程应用到原始强度的值除以辅因子而得到反双曲正弦值。“辅因子”定义的是０周边线性区的大小，较小的辅因子代表更长的线性区域(图9)。33)“辅因子”定义的是０周边线性区的大小，较小的辅因子代表更长的线性区域(图9)34)。