插入并且格式化图像绘图

在这一节中,我们将学习如何:

为查看图像绘图定义相关设置
选择要显示的通道
创建多通道叠加图层,以便创建合并图像

 

注意:本章节中,我们将使用带.dns格式的文件。根据您的分析仪器和导出格式,可以以多种格式插入图片绘图。

 

1.请打开一个新版面。
2.选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。一Data List(数据列表)窗口将出现(图T9.3)。
3.请点击绿色的加号来添加文件NewAdd
4.Files of type:(文件类型:)下拉列表中选择DNS data Stream files (*.dns)(图T18.17)。
5.导航到FCS ExpressTutorial Sample Data archive(教程样本数据库)
6.请选择pictureplotsample1.dnspictureplotsample2.dns,点击Open(打开),来讲这两个文件导入到Data List(数据列表)中

现在,数据列表看上去应如图T26.0所示。

 

Figure T26.0 The Data List after file loading

Figure T26.0 The Data List after file loading

 

5.Data List(数据列表)中拖拽pictureplotsample1.dns到版面上。
6.请在Select Plot Types...(选择绘图类型...)对话框中选择Picture Plot(图像绘图)(请确保其他复选框没被选中)(图T26.1)。

 

Figure T26.1  Choosing to Insert a Picture Plot

Figure T26.1  Choosing to Insert a Picture Plot

 

6.点击OK

这时,在版面上会出现一个图像绘图,如图T26.2所示。

我们现在来修改一下“查看背景选项”,以便仅仅显示单个细胞的蒙版,而不显示图像背景。

注意:数轴上的名称反映了像素坐标。您可以通过修改数轴格式化选项把这些名称关掉。

 

Figure T26.2  Picture Plot for pictureplotsample1.dns Inserted in the Layout

Figure T26.2  Picture Plot for pictureplotsample1.dns Inserted in the Layout

 

7.右击图像绘图。
8.从弹出菜单选择Format(格式)选项。
9.选择Overlays(数据层)项目类别。
10.取消对Show Background Image(显示背景图像)复选框的选择(图T26.3)。

 

Figure T26.3  Deselecting the Show Background Images Option

Figure T26.3  Deselecting the Show Background Images Option

 

11.点击Preview(预览)

请把格式化窗口移到旁边,这样你就可以看到图像绘图了。请注意,现在黑色的背景已经被删除,屏幕上仅仅显示单个的细胞(图T26.4)。

 

Figure T26.4  Before (Left) and After (Right) Removing the Background Image

Figure T26.4  Before (Left) and After (Right) Removing the Background Image

 

我们现在来看一下图像的另外一个通道,然后创建一个两通道合并图像。

12.请点击Cancel(取消),来回到有背景的图像。
13.请把图像绘图复制和粘贴到版面中任意位置。
14.请在新绘图的名称上点击并按住不放(图T26.5)。

 

Figure T26.5  Choosing the DNA Imaging Channel

Figure T26.5  Choosing the DNA Imaging Channel

 

15.选择DNA,来查看图像中的DNA通道(图T26.5)。

现在,图像绘图看起来应该如图T26.6所示,显示和图像绘图相关的DNA图像。

 

Figure T26.6  The DNA Image Channel Associated with pictureplotsample1.dns

Figure T26.6  The DNA Image Channel Associated with pictureplotsample1.dns

 

16.请把显示DNA通道的绘图拖放到显示细胞质通道的绘图上。
17.请从Paste Special(选择性粘贴)对话框中选择2D plot overlay(s)(二维绘图数据层)。
18.点击OK

这时的图像绘图看起来应该如图T26.7所示,DNA通道叠加到了细胞质通道上方,构成了一个合并图像。

 

Figure T26.7  Picture Plot Overlay Displaying the Cytoplasmic and DNA Channels as a Merged Image

Figure T26.7  Picture Plot Overlay Displaying the Cytoplasmic and DNA Channels as a Merged Image

 

就像FCS Express中的任何其它绘图一样,图像绘图中的数据可以使用Next(下一个)Previous(前一个)命令来进行翻动。现在,我们将使用这些命令来改变图像绘图中显示的图像。

19.请点击新建的叠加图层,将其选中。
20.请选择Data(数据)→Change Data on Selection(更改选中数据)→Next(下一个)命令(图T26.8)。

 

Figure T26.8 The Next button

Figure T26.8 The Next button

 

那么,图像绘图将显示Data List(数据列表)中的下一个样本/图像。FCS Express可以处理彩色以及灰度图像(如和pictureplotsample2.dns相关的灰度绘图显示的那样)。

 

在下一节中,我们将学习对图像绘图进行门操作