对图像绘图进行门操作

在这一节中,我们将学习如何:

在图像绘图上添加门
调整图像绘图选项以便查看门
从图像绘图向散点图添加后加门或者从散点图向图像绘图添加后加门
查看图像绘图门对应的统计数据

 

注意:本章节中,我们将使用带.dns格式的文件。根据您的分析仪器和导出格式,可以以多种格式插入图片绘图。

在一个图像绘图上应用门和在FCS Express中的其它绘图上应用门非常类似。想要对门操作有一个初步了解,请查看门操作教程

 

1.请打开一个新版面。
2.选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。一Data List(数据列表)窗口将出现。
3.请点击绿色的加号来添加文件NewAdd
4.Files of type:(文件类型:)下拉列表中选择DNS data Stream files (*.dns)。
5.导航到FCS ExpressTutorial Sample Data archive(教程样本数据库)
6.选择pictureplotsample1.dns。
7.点击Open(打开),来将其导入到Data List(数据列表)中
8.请把pictureplotsample1.dns文件从Data List(数据列表)中拖放到版面上。
9.Select Plot Types...(选择绘图类型...)中选择Color Dot(彩色点)Picture Plot(图像绘图)(请确保没有其他的复选框被选中)(图T26.8)。

 

Figure T26.8  Choosing to Insert a Picture Plot and Color Dot Plot

Figure T26.8  Choosing to Insert a Picture Plot and Color Dot Plot

 

6.点击OK

这时该文件对应的彩色点状图以及图片绘图会出现在版面中。请把这两个图并排排列,如图T26.9所示。

 

Figure T26.9  Arrangement of the Picture Plot and Color Dot Plot on the Layout

Figure T26.9  Arrangement of the Picture Plot and Color Dot Plot on the Layout

 

7.请在图片绘图上创建一个如图T26.10中所示的矩形门,然后将其命名为Picture Plot Gate 1(图片绘图门1)。
8.请在图片绘图上再创建一个如图T26.10中所示的门(椭圆形门)并将其命名为Picture Plot Gate 2(图片绘图门2)。

 

Figure T26.10  Creating Gates on the Picture Plot 

Figure T26.10  Creating Gates on the Picture Plot 

 

注意:图片绘图中在门中的细胞也被高亮为和门相同的颜色(图T26.10)。同时,彩色点状图中,与图片绘图门中相对应的细胞,显示的颜色与图片绘图门不一样。有时,在点状图上区分不同颜色或者不同事件可能会有些困难,因为一个图片只有有限的事件数。我们现在要对点状图进行格式化,以便更加容易地对其进行查看和分析。

9.请右键点击彩色散点图。
10.从弹出菜单选择Format(格式)选项。
11.选择Overlays(数据层)项目。
12.更改Dot Size(点大小)为“5”(图T26.10b)。

 

Figure T26.10b Formatting Dot Size

Figure T26.10b Formatting Dot Size

 

 

13.点击OK

此时,散点图看起来应该如图T26.11所示,在每个图片绘图门中的事件也更容易区分。

 

Figure T26.11  Color Dot Plot with Dots Enlarged 

Figure T26.11  Color Dot Plot with Dots Enlarged 

 

我们现在要对图像绘图进行格式化,让其只突出显示两个图片绘图门中,其中一个门里的细胞。

 

14.右击图像绘图。
15.从弹出菜单选择Format(格式)选项。
16.选择Picture Plot Options(图片绘图选项)→Display Gates Options(显示门选项)类别选项。
17.选择All gates except those checked below(除了下面选中的门之外的所有门)单选按钮(图T26.12)。
18.选中复选框Picture Plot Gate 2(图片绘图门2)(图T26.12)。

 

Figure T26.12  Choosing to Display All Gates Except Picture Plot Gate 2

Figure T26.12  Choosing to Display All Gates Except Picture Plot Gate 2

 

19.点击OK

这时,图片绘图看起来应该如图T26.13所示,图中仅仅突出显示图片绘图门1中的细胞。

 

Figure T26.13  Picture Plot Highlighting Only Cells Found Within Picture Plot Gate 1

Figure T26.13  Picture Plot Highlighting Only Cells Found Within Picture Plot Gate 1

 

我们现在将根据图片绘图门来对彩色点状图进行门操作。

20.请点击彩色点状图,将其选中。
21.导航到Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Current Gate(当前门),然后从Current Gate(当前门)下拉列表中选择Picture Plot Gate 1(图片绘图门1)(图T26.13b)。

 

FIgure T26.13b Applying Picture Plot Gate 1

FIgure T26.13b Applying Picture Plot Gate 1

 

注意:彩色点状图现在被更改为只显示图片绘图上门中定义的事件(图T26.14)。

 

Figure 27.14  Color Dot Plot Displaying Cells from Picture Plot Gate 1

Figure 27.14  Color Dot Plot Displaying Cells from Picture Plot Gate 1

 

现在,我们将在彩色点状图上设置一个门,并将其应用到图片绘图上。

22.请按下CTRL+Z,取消把门操作(此时,绘图看上去应如图T26.11所示)。
23.请在彩色点状图上创建一个如图T26.15中所示的矩形门并将其命名为Dot Plot Gate(点状图门)

 

Figure T26.15  Applying a Gate to the Dot Plot

Figure T26.15  Applying a Gate to the Dot Plot

 

注意:图像绘图现在以刚在彩色点图中创建的门的颜色,来高亮显示细胞(图T26.16)。请移动一下点状图门,来观察图像绘图中高亮显示的细胞随点状图门移动而变化的情况。在根据数值结果来识别图片中某一细胞群时,这种门操作的方法可能会比较有用。

 

Figure T26.16  Picture Plot Displaying the Dot Plot Gated Cells in Purple

Figure T26.16  Picture Plot Displaying the Dot Plot Gated Cells in Purple

 

通过删除背景图片,点状图门中单独的细胞也可以显示在图片绘图中。

24.右击图像绘图。
25.从弹出菜单选择Format(格式)选项。
26.选择Overlays(数据层)项目。
27.取消对Show Background Image(显示背景图像)的选择(图T26.3)。
28.点击OK
29.导航到Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Current Gate(当前门),然后从Current Gate(当前门)下拉列表中选择Dot Plot Gate(点状图门)。

现在,图像绘图看起来应该如图T26.17所示,只显示在点状图门中的细胞。请移动一下点状图门,并实时观察图像绘图中细胞的变化。

 

Figure T26.17  Picture Plot with Dot Plot Gate Applied

Figure T26.17  Picture Plot with Dot Plot Gate Applied

 

下一章节,我们将为图像分析使用数据网格