在本例中,我们会:
• | 学习如何设置面板。 |
• | 学习如何设置一个用来分析的实验文件列表。 |
本教程中,我们将分析2个样本,每个样本包含2个样本管组。这一面板将由样本管组组成。
我们将从定义面板开始,然后设置文件列表。
1. | 请打开一个新的空白版面。 |
2. | 请选择Batch(批处理)→Organize Data Sets(组织数据集)→Panels(面板)命令(图T10.1)。或者,请选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Panels(面板)命令。 |
Figure T10.1 Selecting the Panels Command
此时,Panel Information(面板信息)对话框将出现,如图T10.2所示。
Figure T10.2 Panel Information Dialog
3. | 点击Add(添加)按钮(图T10.2)。 |
此时,Add Panel(添加面板)对话框将出现,如图T10.3A所示。
4. | 输入“My Panel(我的面板)”到Panel Name(面板名称)域。![]() |
5. | 请点击Number of Tubes(试管数目)数字调控按钮上向上的箭头,直到该字段变成2。这时对话框看起来应该如图T10.3B所示。![]() |
6. | 在Name(名字)列,将Tube #1命名为"T cell markers(T细胞标识)"和Tube #2 命名为"B cell markers(B细胞标识)",此时对话框看起来应如图T10.3C所示。![]() |
7. | 点击OK,来关闭Add Panel(添加面板)对话框。![]() |
Figure T10.3 Setting up a Panel using the Add Panel Dialog
此时,Panel Information(面板信息)对话框含有更新过的、新加的面板信息,如图T10.4所示。
Figure T10.4 Updated Panel Information Dialog
8. | 点击OK,来关闭Panel Information(面板信息)对话框(图T10.4)。 |
下一步包括使用Data List(数据列表)来设置我们想要使用面板进行分析的文件列表。
9. | 请选择Data(数据)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令(图T10.5)。或者,请选择Batch(批处理)→Organize Data Sets(组织数据集)→Data List(数据列表)命令。 |
Figure T10.5 Selecting the Data List Command
此时,Data List(数据列表)窗口将打开,如图T10.6所示。
Figure T10.6 Data List Window
10. | 点击Data List(数据列表) ![]() |
此时,Select a Data File(选择一数据文件)对话框将打开(图T10.7)。
11. | 请来到教程 样本数据文件夹中。 |
12. | 选择Normal2_Tube1、Normal2_Tube2、Normal3_Tube1和Normal3_Tube2这四个文件,如图T10.7所示。(要一次选择多个文件,请先点击第一个文件Normal2_Tube1,然后请在键盘上按下Shift键不放,再点击最后一个文件Normal3_Tube2) |
13. | 点击Open(打开)(图T10.7)。 |
Figure T10.7 Selecting Data Files to insert into the Data List.
现在Data List(数据列表)窗口针对刚选中的文件进行了更新。现在,Data List(数据列表)窗口看起来应该如图T10.8所示,虽然用户计算机上的路径名称可能会不同。
Figure T10.8 Updated Data List with Corresponding Tubes for the Panel
在图T10.8中,Data List(数据列表)窗口显示了你创建于左边列的试管和你添加到右边列的文件。这种方式会非常好地帮助用户把文件和相关试管组织起来,以备将来分析所用。如要进一步帮助组织数据文件,FCS Express可以让用户把FCS文件中的关键字添加到文件列表所显示的信息中。关键字是样本鉴定的描述性指标,可被添加到数据列表中,来轻松识别哪个数据文件与数据列表中的各个项目相对应。有很多关键字都可被用来在数据列表中识别数据文件。本教程中,我们将添加$SRC关键字到数据列表中。
14. | 点击数据列表中的一个样本,将其选中。 |
15. | 点击Data List(数据列表)顶端的Format(格式)按钮,如图T10.8所示。 |
此时,Format File List(格式文件列表)对话框将出现,如图T10.9所示。
16. | 请从Format File List(格式文件列表)对话框中选择Add(添加)。 |
Figure T10.9 Format File List Dialog
此时,Please select one or more keywords(请选择一个或多个关键字)对话框将出现,如图T10.10所示。在此我们将选择$SRC关键字,来显示在Data List(数据列表)中。
17. | 请点击滑动条向下的箭头来到列表的底部。 |
18. | 点击$SRC将其选中,如图T10.10所示。如果想要显示多个关键字,您可以通过按下Shift键来选中多个相邻的关键字;或者在点击每个关键字的同时,按下Ctrl键,来选择多个不相邻的关键字。在本例中,我们仅仅选择$SRC。 |
19. | 点击OK(图T10.10)。 |
Figure T10.10 Selecting an FCS Keyword to use in the Data List
此时,Format File List(格式文件列表)对话框将在Selected Keywords(选中的关键字)字段进行更新,来显示$SRC关键字,如图T10.12所示。同样,数据列表也可被格式化来不显示数据文件的保存路。数据列表也可被格式化来以分组的形式显示您的数据。
Figure T10.12 Updated Format File List Dialog with $SRC as the Selected Keyword
20. | 取消对Show Full Path(显示完全路径)复选框的选择,选中Show Iteration Column(显示循环列),如图T10.12所示。 |
21. | 选择Format File List(格式文件列表)对话框中的OK。 |
此时,Data List(数据列表)对话框将进行更新,来显示数据文件的分组情况,且显示的文件名中不带有完全路径,而带有$SRC列,如图T10.13所示。
Figure T10.13 Data List Window Updated with Groups, File Names and $SRC Column.
用户可以使用Data List(数据列表)对话框上方的图标(Figure T10.13)来操纵列表中的数据文件。
如前面演示的那样,用户可以点选添加键来添加更多的数据文件,也可以点击Format (格式)按钮来添加更多的关键字。
要在Data List(数据列表)中上下移动文件,请选择向上
或向下
箭头。要更改一文件,请选择Change File(更改文件)按钮,
要查找文件,请点选Search(查找)按钮。
要从列表中删除一个文件,请将该文件选中,然后点击Delete(删除)按钮
。
在FCS Express第四版中,如果数据列表中的试管的顺序做了任何更改,显示这些数据文件的绘图的位置也会自动更改。如果你的文件很大,当数据列表中的每个试管都向上或者向下移动时,版面可能需要一定时间来进行更新。
但是,在FCS Express 5中,用户可以将这样的更新推迟,直到将文件都移动到你想要的位置。通过点击Defer Layout Changes(推迟版面更改)图标,用户可以对试管的顺序做更改,然后取消对这一图标的选择,分析版面中的数据就将自动更新。
现在,我们将创建版面。