在本例中,我们将:

为我们的面板创建一个版面。

现在我们用以前创建的面板来创建一个版面,用以分析我们的实验数据。我们将使用绘图和门。请参见以前的教程来详细了解插入绘图格式化绘图门的使用

请继续使用在前面章节(设置面板教程)中,我们用到的版面,我们将为第一组样本创建四个绘图。

1.请打开Data List(数据列表)窗口,如果它还没打开的话。
2.选择列表中的前两个文件(点击第一个文件,按下Shift键,然后再点击第二个文件)。
3.请把选中的文件拖到Data List(数据列表)对话框的外边。
4.松开鼠标键,把文件放到版面中的空白处。

此时,Select Plot Types... (选择绘图类型...)对话框将出现,如图T10.14所示。

5.请选中Color Dot(彩色点状图)选项,然后取消对其它绘图类型的选择。
6.请选中Use this selection for all files(对所有文件使用这个选择)选项。
7.点击OK(图T10.14)。
8.注意:在第5版中,FCS Express可以记住您的选择,当要在该版面中,通过从数据列表拖拽文件来创建新绘图时,您之前的选择将被作为默认的绘图类型。

 

 

Figure T10.14  Select Plot Types... Dialog

Figure T10.14  Select Plot Types... Dialog

 

现在,利用Data List(数据列表)前两个文件创建的两个彩色点状图,就出现在版面中了。现在,我们要把这两个图排成一列,放在版面的左侧。

8.通过按下Ctrl键,然后点击鼠标左键,来选中我们需要的绘图。也许需要移动密度图来单独选择某一个绘图。或者,请按下鼠标键,拖出一个包括四个绘图的框,或者选择Home(主页)→Editing(编辑)→Select All(选中所有)命令。
9.请从Home(主页) → Editing(编辑) → Arrange(排列)中,选择Align(对齐)命令(图T10.15)。这一工具将帮助我们对齐和分类我们的对象,这些对象将向按下Ctrl键后,点击的第一个对象看齐。

 

Figure T10.15  Aligning Plots

Figure T10.15  Aligning Plots

 

此时,Alignment(对齐)窗口看上去将如图T10.16所示。

10.请在“Horizontal(水平)”列下,选择Left Sides(左边)。请在“Vertical(垂直)”列下,选择“No Change(无变化)”
11.点击OK

 

Figure T10.16  Aligning Plots on the Left Side

Figure T10.16  Aligning Plots on the Left Side

 

12.选择这一绘图。右键点击它,然后选择Duplicate(做副本)(图T10.17)。

 

Figure T10.17  Duplicating Plots

Figure T10.17  Duplicating Plots

 

现在,将出现一个复制的绘图(图T10.18)。

13.请把复制的绘图放在原绘图的右侧,进行重新排列。
14.如果需要,可使用对齐工具。

 

Figure T10.18  Duplicated Plots

Figure T10.18  Duplicated Plots

 

此时,版面页将如图T10.19所示。要更多地了解FCS Express中操纵对象的信息,请参见Using Objects(使用对象)教程

 

Figure T10.19  Plots Arranged on Page

Figure T10.19  Plots Arranged on Page

 

我们现在将调整X 轴和Y轴的参数创建门创建统计和创建一个一维柱状图到我们将添加的Overlay(数据层)上

16.在左上角的第一个绘图中,点击X轴,然后选择“V-500-A”。点击Y轴,然后选择“SSC-A”
17.在右上角的第二个绘图中,点击X轴,然后选择“V450-A”。点击Y轴,然后选择“PerCP-Cy5-5-A”
18.在左下角的第三个绘图中,用同样的方法设置X轴为“APC-H7-A”,设置Y轴为“V450-A”
19.在左下角的第三个绘图中,设置X轴为“APC-A”,设置Y轴为“PE-A”
20.此时,版面看上去将如图T10.20所示。
Figure T10.20 Plots with X and Y axis set to Parameters

Figure T10.20 Plots with X and Y axis set to Parameters

 

21.我们同样可对绘图标题进行格式化,让它包含该绘图的当前门信息。
22.要选择所以绘图,请从Home(主页)标签中选择Select All(选中所有)或者通过点击CTRL+A键
23.从Format(格式)标签中,选择Titles(标题)。如果您使用的是默认参数,很可能关键字<$FCSE_FILENAMENOPATH>将被输入来作为标题。请把光标放在<$FCSE_FILENAMENOPATH>后,然后点击Insert Keyword(插入关键字)。从下拉菜单中选择当前门,如图T10.21所示。点击OK
Figure T10.21 - Before and After Adding Current Gate to the Plot Title

Figure T10.21 - Before and After Adding Current Gate to the Plot Title

24.我们将创建门。在SSC/V500-A绘图中,我们将在淋巴细胞周围创建一个多边形门。请从Gating(门操作)标签中选择Polygon(多边形门),然后再淋巴细胞群周围创建该门。将该门命名为“Lymphs“,如图T10.21所示。
Figure T10.21 - Creating a Lymphs gate

Figure T10.21 - Creating a Lymphs gate

25.我们将在右上角的第二个绘图中,应用“Lymphs“门,方法是将该门拖拽到第二个绘图的顶部。拖拽前和拖拽后均展示于图T10.22。
Figure T10.22 - Before and After Dragging and Dropping the Lymphs Gate

Figure T10.22 - Before and After Dragging and Dropping the Lymphs Gate

26.选中该页中靠下面的2个绘图。在Gating(门操作)标签中,选择Current Gate(当前门)下拉菜单中的“Lymphs“,如图T10.23所示。
Figure T10.23 - Selecting Lymphs from the Current Gate Drop Down Menu

Figure T10.23 - Selecting Lymphs from the Current Gate Drop Down Menu

 

27.在左下角的第三个绘图中,在APC-H7/V450双阳性细胞群的周围创建一个矩形门。将该门命名为“Cells of Interest”
28.通过拖拽的方法,把“Cells of Interest”门应用到右下角的第四个绘图中。
29.要编辑版面中上面2个绘图要显示的门,请从Format(格式)标签中选择Gates to Display(要显示的门)
30.请在Gate Options(门选项)下面选择Only the gates checked below(只显示下面选中的门)。选择“Lymphs”门
31.针对下面这个问题(当在版面中创建一个新门时,该门的颜色会显示吗?),请选择“Only if the gate was create on a plot showing the same data file as this plot(只有当创建在绘图上的门和绘图显示的是同一数据文件时)”选项,如图T10.24所示。点击OK
Figure T10.24 - Editing the Gates to Display

Figure T10.24 - Editing the Gates to Display

32.此时,版面看上去应如图T10.25所示。
Figure T10.25

Figure T10.25

33.我们将在右上角和右下角的绘图中添加象限。请从Gating(门操作)标签中,点击Quadrants(象限),然后在V450 vs PerCPCy5.5绘图上点击。可以通过点击象限中央的十字交叉点,来移动象限,调整到合适的位置。
34.针对APC vs PE绘图重复第33步。
35.此时,您的版面看上去将如图T10.26所示。
Figure T10.26

Figure T10.26

36.现在,我们将为包含有象限的2个绘图添加象限统计。
37.请在V450 vs PerCPCy5.5绘图上,点击鼠标右键,然后选择Statistics(统计)>Quadrant Statistics(象限统计)。右键点击统计表格,除Gate(门)# of Events(事件数)% of Gated Cells(门中细胞百分比)% of All Cells(占总细胞百分比)列外,请取消对其他选项的选择,如图T10.27所示。
Figure T10.27 - Formatting Statistics

Figure T10.27 - Formatting Statistics

38.从右键点击后的弹出菜单中,您可以选择Format(格式)>Stats(统计),来编辑您想要查看的列。
39.针对APC vs PE绘图,重复第36&37步。
40.同样,您可以编辑FCS Express用户选项,来反映这些改变,但不是每个元件都需要手动编辑。
41.我们现在将增加另外一个页面,然后再该页面中添加一个一维柱状图。
42.请从Insert(插入)标签中,选择New Page(新页面)。我们也可点击版面底部Page 1(第一页)后面的"+"号,来添加一个新页面。
43.将Data List(数据列表)中的第二个数据拖拽到Page 2中。
44.选择Histogram(柱状图)。点击OK
45.更改X轴坐标为“PE-A”,更改当前门卫“Lymphs”门
46.在柱状图上点击鼠标右键,选择Add Overlay(添加叠加图层),如图T10.28所示。
Figure T10.28 - Adding an Overlay

Figure T10.28 - Adding an Overlay

47.请在Select a Data File(选择一个数据文件)窗口,选择Data List(数据列表)标签,然后选择第二管数据。点击Open(打开),如图T10.29所示。
Figure T10.29 - Selecting a Data File for Overlay

Figure T10.29 - Selecting a Data File for Overlay

48.请在Add Overlay(添加叠加图层)窗口的Parameter(参数)部分,选择“APC-A”。如果还没有选择“Lymphs”门的话,请选将它选中,如图T10.30所示。点击OK
Figure T10.30 - Adding the Overlay

Figure T10.30 - Adding the Overlay

49.此时,您的柱状图看起来应如图T10.31所示。
Figure T10.31 - Histogram with Overlay

Figure T10.31 - Histogram with Overlay

50.现在,我们将把这个版面保存。请从File(文件)标签中选择Save As(保存为)。在选择好版面将保存的位置后,请从Data Link Style(数据链接类型)部分选择Unlinked(不链接),如图T10.32所示。这将把您的版面保存为一个空的模板。点击Save(保存)
51.然后,关闭版面。

 

在下一节中,我们将学习“面板的使用”