在本例中,我们将:
现在我们用以前创建的面板来创建一个版面,用以分析我们的实验数据。我们将使用绘图和门。请参见以前的教程来详细了解插入绘图、格式化绘图和门的使用。
请继续使用在前面章节(设置面板教程)中,我们用到的版面,我们将为第一组样本创建四个绘图。
1. | 请打开Data List(数据列表)窗口,如果它还没打开的话。 |
2. | 选择列表中的前两个文件(点击第一个文件,按下Shift键,然后再点击第二个文件)。 |
3. | 请把选中的文件拖到Data List(数据列表)对话框的外边。 |
此时,Select Plot Types... (选择绘图类型...)对话框将出现,如图T10.14所示。
5. | 请选中Color Dot(彩色点状图)选项,然后取消对其它绘图类型的选择。 |
6. | 请选中Use this selection for all files(对所有文件使用这个选择)选项。 |
8. | 注意:在第5版中,FCS Express可以记住您的选择,当要在该版面中,通过从数据列表拖拽文件来创建新绘图时,您之前的选择将被作为默认的绘图类型。 |

Figure T10.14 Select Plot Types... Dialog
现在,利用Data List(数据列表)前两个文件创建的两个彩色点状图,就出现在版面中了。现在,我们要把这两个图排成一列,放在版面的左侧。
8. | 通过按下Ctrl键,然后点击鼠标左键,来选中我们需要的绘图。也许需要移动密度图来单独选择某一个绘图。或者,请按下鼠标键,拖出一个包括四个绘图的框,或者选择Home(主页)→Editing(编辑)→Select All(选中所有)命令。 |
9. | 请从Home(主页) → Editing(编辑) → Arrange(排列)中,选择Align(对齐)命令(图T10.15)。这一工具将帮助我们对齐和分类我们的对象,这些对象将向按下Ctrl键后,点击的第一个对象看齐。 |

Figure T10.15 Aligning Plots
此时,Alignment(对齐)窗口看上去将如图T10.16所示。
10. | 请在“Horizontal(水平)”列下,选择Left Sides(左边)。请在“Vertical(垂直)”列下,选择“No Change(无变化)”。 |

Figure T10.16 Aligning Plots on the Left Side
12. | 选择这一绘图。右键点击它,然后选择Duplicate(做副本)(图T10.17)。 |

Figure T10.17 Duplicating Plots
现在,将出现一个复制的绘图(图T10.18)。
13. | 请把复制的绘图放在原绘图的右侧,进行重新排列。 |

Figure T10.18 Duplicated Plots
此时,版面页将如图T10.19所示。要更多地了解FCS Express中操纵对象的信息,请参见Using Objects(使用对象)教程。

Figure T10.19 Plots Arranged on Page
我们现在将调整X 轴和Y轴的参数、创建门、创建统计和创建一个一维柱状图到我们将添加的Overlay(数据层)上。
16. | 在左上角的第一个绘图中,点击X轴,然后选择“V-500-A”。点击Y轴,然后选择“SSC-A”。 |
17. | 在右上角的第二个绘图中,点击X轴,然后选择“V450-A”。点击Y轴,然后选择“PerCP-Cy5-5-A”。 |
18. | 在左下角的第三个绘图中,用同样的方法设置X轴为“APC-H7-A”,设置Y轴为“V450-A”。 |
19. | 在左下角的第三个绘图中,设置X轴为“APC-A”,设置Y轴为“PE-A”。 |

Figure T10.20 Plots with X and Y axis set to Parameters
21. | 我们同样可对绘图标题进行格式化,让它包含该绘图的当前门信息。 |
22. | 要选择所以绘图,请从Home(主页)标签中选择Select All(选中所有)或者通过点击CTRL+A键。 |
23. | 从Format(格式)标签中,选择Titles(标题)。如果您使用的是默认参数,很可能关键字<$FCSE_FILENAMENOPATH>将被输入来作为标题。请把光标放在<$FCSE_FILENAMENOPATH>后,然后点击Insert Keyword(插入关键字)。从下拉菜单中选择当前门,如图T10.21所示。点击OK。 |

Figure T10.21 - Before and After Adding Current Gate to the Plot Title
24. | 我们将创建门。在SSC/V500-A绘图中,我们将在淋巴细胞周围创建一个多边形门。请从Gating(门操作)标签中选择Polygon(多边形门),然后再淋巴细胞群周围创建该门。将该门命名为“Lymphs“,如图T10.21所示。 |

Figure T10.21 - Creating a Lymphs gate
25. | 我们将在右上角的第二个绘图中,应用“Lymphs“门,方法是将该门拖拽到第二个绘图的顶部。拖拽前和拖拽后均展示于图T10.22。 |

Figure T10.22 - Before and After Dragging and Dropping the Lymphs Gate
26. | 选中该页中靠下面的2个绘图。在Gating(门操作)标签中,选择Current Gate(当前门)下拉菜单中的“Lymphs“,如图T10.23所示。 |

Figure T10.23 - Selecting Lymphs from the Current Gate Drop Down Menu
27. | 在左下角的第三个绘图中,在APC-H7/V450双阳性细胞群的周围创建一个矩形门。将该门命名为“Cells of Interest”。 |
28. | 通过拖拽的方法,把“Cells of Interest”门应用到右下角的第四个绘图中。 |
29. | 要编辑版面中上面2个绘图要显示的门,请从Format(格式)标签中选择Gates to Display(要显示的门)。 |
30. | 请在Gate Options(门选项)下面选择Only the gates checked below(只显示下面选中的门)。选择“Lymphs”门。 |
31. | 针对下面这个问题(当在版面中创建一个新门时,该门的颜色会显示吗?),请选择“Only if the gate was create on a plot showing the same data file as this plot(只有当创建在绘图上的门和绘图显示的是同一数据文件时)”选项,如图T10.24所示。点击OK。 |

Figure T10.24 - Editing the Gates to Display

Figure T10.25
33. | 我们将在右上角和右下角的绘图中添加象限。请从Gating(门操作)标签中,点击Quadrants(象限),然后在V450 vs PerCPCy5.5绘图上点击。可以通过点击象限中央的十字交叉点,来移动象限,调整到合适的位置。 |
35. | 此时,您的版面看上去将如图T10.26所示。 |

Figure T10.26
36. | 现在,我们将为包含有象限的2个绘图添加象限统计。 |
37. | 请在V450 vs PerCPCy5.5绘图上,点击鼠标右键,然后选择Statistics(统计)>Quadrant Statistics(象限统计)。右键点击统计表格,除Gate(门)、# of Events(事件数)、% of Gated Cells(门中细胞百分比)和% of All Cells(占总细胞百分比)列外,请取消对其他选项的选择,如图T10.27所示。 |

Figure T10.27 - Formatting Statistics
39. | 针对APC vs PE绘图,重复第36&37步。 |
40. | 同样,您可以编辑FCS Express用户选项,来反映这些改变,但不是每个元件都需要手动编辑。 |
41. | 我们现在将增加另外一个页面,然后再该页面中添加一个一维柱状图。 |
42. | 请从Insert(插入)标签中,选择New Page(新页面)。我们也可点击版面底部Page 1(第一页)后面的"+"号,来添加一个新页面。 |
43. | 将Data List(数据列表)中的第二个数据拖拽到Page 2中。 |
44. | 选择Histogram(柱状图)。点击OK。 |
45. | 更改X轴坐标为“PE-A”,更改当前门卫“Lymphs”门。 |
46. | 在柱状图上点击鼠标右键,选择Add Overlay(添加叠加图层),如图T10.28所示。 |

Figure T10.28 - Adding an Overlay
47. | 请在Select a Data File(选择一个数据文件)窗口,选择Data List(数据列表)标签,然后选择第二管数据。点击Open(打开),如图T10.29所示。 |

Figure T10.29 - Selecting a Data File for Overlay
48. | 请在Add Overlay(添加叠加图层)窗口的Parameter(参数)部分,选择“APC-A”。如果还没有选择“Lymphs”门的话,请选将它选中,如图T10.30所示。点击OK。 |

Figure T10.30 - Adding the Overlay
49. | 此时,您的柱状图看起来应如图T10.31所示。 |

Figure T10.31 - Histogram with Overlay
50. | 现在,我们将把这个版面保存。请从File(文件)标签中选择Save As(保存为)。在选择好版面将保存的位置后,请从Data Link Style(数据链接类型)部分选择Unlinked(不链接),如图T10.32所示。这将把您的版面保存为一个空的模板。点击Save(保存)。 |
在下一节中,我们将学习“面板的使用”。