DNS Macro Example Overview(DNS宏案例概述))

DNS Macro Example Macro(DNS宏案例)可以将您的图片加工、输出结果分段、细胞图片分析结果单一化,让它们变成FCS Express 5 Image Cytometry可读数据。在以下列出的5个案例中,DNS宏可以从ImageJ中加工和输出图片。

 

 

A. A set of single standalone images(一组单一独立的图像):

 

1.在一个文件夹中一组单一独立的图像:例如,一系列来自不同样本的单一图像(一个通道)。如果用户选择一个文件夹,DNS宏会在该文件夹中为每个有效的图片文件生成一个.ijout文件。   (如果您想要增加ImageJ支持的其他格式的图片,请在DNS宏中选择和/或更新"function validImageFileName(运行有效的图片文件名称)"和"function MaskImageFile(运行面罩图片名称)" 这意味着一个子文件夹带有每个文件的面罩/结果。.ijout文件将以每个原始图片文件的名称来命名。只有在这个案例中,不需要用到分析配置文件。

 

2. 已经通过一.IJX文件将一组单一独立的图像定义好了。例如,一系列来自不同样本的单一图像。如果用户选择一个.IJX分析配置文件,该分析配置文件只包含文件名(可能只有一个),然后和上面一样,但只针对.IJX文件中的文件。

 

B. 一组带多通道的图像。例如,来自包含不只一个通道的不同样本的一系列图片,如DAPI和FITC共染。如果用户选择一.IJX文件,该文件有多组通道、没有孔,DNS宏就会为每组通道生成一 IJOUT文件,和选择的mask的命名相同。DNS宏将使用通道来创建面罩。

 

C. 一组来自多孔板基础试验的图像。.IJX文件可容纳多通道图像和多字段位置。例如,每孔带有2通道图像和4个字段的96孔板。如果用户选择带有多孔的一个板(带有通道)的.IJX文件,针对整个板子,DNS宏只会生成一个.IJOUT文件,且以.IJX文件名来命名。DNS宏将使用通道来创建面罩。

 

D. 一组图像,用来组成更大的平铺或蒙太奇图像。例如,通过多个20x字段成像的大薄片。如果用户选择一个多通道、不带孔的.IJX文件。当一个大图像被切割成多个小片段(或起源于一个未缝合的                蒙太奇图像组),来对每段执行分析。

 

 

如果DNS宏文件安装在ImageJ中(Plugins(插件)Macros(宏)Install(安装)),一个带有三色斑点按钮的红色矩形将显示在工具栏中,三色斑点按钮带有“De Novo Software Exporter(De Novo Software出口商)”暗示(图T28.92)。

 

Figure T28.92 The ImageJ tool bar with the DnsExampleMacro.ijm (De Novo Software Exporter) installed.

Figure T28.92 The ImageJ tool bar with the DnsExampleMacro.ijm (De Novo Software Exporter) installed.

 

自定义宏的功能就是在宏的最后一行后添加以下文本:

// - - - - - - - - - The functions below this line are the ones that the user can customize (这条线以下的功能,用户可以自定义)- - - - - - - - - - -