ImageJ Macros General Overview(图像J宏概述)

De Novo Software提供两种ImageJ macros(图像J宏),来帮助用户从ImageJ中输出图片分析到FCS Express Image Cytometry软件中。ImageJ宏可以从De Novo Software网站下载,网站是www.denovosoftware.com/site/imageJ.shtml.

 

 

总体概述:

 

De Novo Software提供的宏可用在以下地方:

 

 

DNS Macro Example Macro(DNS宏示例宏):
oDNSMacroExample.ijm 宏可以将您的图片加工并输出部分结果、单一细胞群图片分析结果,以FCS Express Image Cytometry可读数据方式。该宏将加工图片,生成:

 

1.接着对象的数字结果的对象
2.部分对象的掩码图片
3.一个*.ijout文件从FCS Express Image Cytometry中导入,当相关的结果返回到原始图像中时,将会检查接着对象的数据的对象。

 

 

该宏可以分析来自以下列出案例的图片(要了解案例应用详情,请参见DNS Macro Example Overview(DNS宏案例概述))

 

一组单一独立的图像
一张图片带有多个通道(例如Red、Green和Blue或者DAPI、CD4和Protein X等等)
图片来自多孔板的多个孔(例如96孔板)
图片来自视野中的多个域(例如多孔板或者一个平铺/蒙太奇图片中一个孔的多个域)
视野中多个通道、多个孔和多个域的任意组合

 

 

DNS Analysis Creator Macro(DNS分析生成宏):
o创建一个*.IJX分析的配置文件,ImageJ可以用其来对上面提到的集中的图片进行排序、组群和加工。(要详细了解案例的使用,请参见DNS Analysis Creator Overview(DNS分析创造概述)章节)

 

当图片属于一个分组,用户必须生成一个带.IJX伸展的分析配置文件。此分析配置文件会告知FCS Express,不同的图片是如何关联的。例如,如果来自一个单一域的两个图片分别代表通道1和通道2,或者由96张单独图片组成一个96孔板基础实验。此DNSAnalysisCreator.ijm宏已经设置成去帮助用户创建分析配置文件。