DNS Analysis Creator Macro(DNS分析创造宏)创建了一个*.ijx分析配置文件,ImageJ可用该分析配置文件对集合中的图像进行排序、组群和加工,详细介绍请见DNS Macro Example Overview(DNS宏案例概述))。
该分析配置文件是一个逗号分隔值(.csv)文本文件,带有一.ijx扩展名。文件的第一行必须包含一个列标题。例如:文件名称,通道。
对于.ijx文件中有效的列标题为:
Filename(文件名):它必须是第一个字段,必须有完整的限定路径到文件中,包括完整的路径。它不能是空着的。例如,c:\image data\img004.jpg。
Channel(通道):(自选操作)如果存在,那它就是第二个字段。它不能是空着的。例如,它可以是:绿色。通道的名称,用户可以按照自己喜好来命名,但必须在不同的微孔或视野间进行重复。
Well(微孔门):(自选操作)如果存在,那它就是第三个字段。它不能是空着的。它的格式是1个或者2个字母(a..z或A..Z范围),后面跟着最多4个数字(0..9范围)。例如,它可以是B07。
FOV_row(视野_行):(自选操作) 它是一个拼贴图像中,它是视野或者拼贴/缝合的位置的行数。根据您的说明书,视野会在一个网格中重新组装。如果它存在,也有“Well(微孔)”的话,那它就在第四个字段;如果“Well(微孔)”不存在,那它就在第三个字段。它不能是空着的。它必须是一个整数,表明field of view(视野)的行数,从0开始。例如,0
FOV_col(视野_列):(自选操作) 它是一个拼贴图像中,它是视野或者拼贴/缝合的位置的列数。根据您的说明书,视野会在一个网格中重新组装。如果它存在,也有“Well(微孔)”的话,那它就在第五个字段;如果“Well(微孔)”不存在,那它就在第四个字段。它不能是空着的。如果FOV_row column存在,那么FOV_col(视野_列)也会存在。它必须是一个整数,表明field of view(视野)的列数,从0开始。例如,0
下面是标题的例子:
Filename(文件名)
Filename(文件名),Channel(通道)
Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔)
Filename(文件名),Channel(通道),FOV_row(视野_行),FOV_col(视野_列)
Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔),FOV_row(视野_行),FOV_col(视野_列)
附加注意事项:
a. | 图像文件名称中至少有一列带有全路径。如果存在随后的列,那所有的介入列也必须存在。例如,如果您选择Filename(文件名)和Well(微孔门)那您必须还具有一个Channel列存在,最后的结果会是Filename(文件名),Channel(通道),Well(微孔)。 |
b. | 标题关键字有大小写之分。 |
c. | 该字段处没有默认值。这意味着两个连续的分隔符,是不允许的。 |
如何创建一个.lJX文件。
分析配置文件(*.IJX文件)可通过以下方式创建:
• | Using the DNS Analysis Creator Macro(使用DNS分析创造宏) |