ImageJ可以直接编辑一个由DNS Analysis Creator Macro(DNS分析创造宏)创建的.IJX文件。
1. | 点击File(文件)→Open in ImageJ。 |
2. | 请导航到Tutorial Sample Data(教程样本数据)文件夹中的Multichannel Image Experiment文件夹→ImageJ Tutorial文件夹。 |
3. | 双击FileListForDnsExporter.ijx文件,将其打开。 |
此FileListForDnsExporter.ijx文件将在ImageJ文本编辑器中打开,如下图T28.108所示。自动创建的默认文件为这些信息所有可能的情境创建列标题和带有占位符的行(表示文本在小于和等于符号/括号之间,{FT0})。您会注意到,在第6行(在底部)中,如果需要,会包括基于板子实验的信息。我们现在要对文件进行编辑,让它只包含文件名和通道的列标题,每行中只有相关的通道信息。
Figure T28.108 The FileListForDnsExporter.ijx file opened in ImageJ that was created in the previous steps.
4. | 从第一排中删除Well,FOV_row和FOV_col。 |
5. | 从最后一排中删除#Plate Info,Rows,<rows>,Columns(列),<cols>。 |
6. | 删除所有<WellID>,<FOV_row>和<FOV_col>。 |
7. | 用来自图片名称的各自通道名称<Channel_Name>来代替文本。 |
例如:在第2行中的图像名称是Image1DAPI.jpg。在本例中,用DAPI来取代<Channel_Name>用DAPI来替代。 同样,在交替行中用FITC取代{FT5}。
当您完成对FileListForDnsExporter.ijx文件的编辑,它现在应如下图T28.109所示。
Figure T28.109 The FilelistForDnsExpoter.ijx file in ImageJ after editing to remove extra column headers, plate information, and adding the channel information.
8. | 在 ImageJ文本编辑器中,点击File→Save选项。 |
您现在就可编辑和保存来自两个图像实验的两个通道的分析配置文件。