Microsoft Excel可以直接编辑一个由DNS Analysis Creator Macro(DNS分析创造宏)创建的.IJX文件。

 

Editing the .ijx file in Excel(在Excel中编辑.ijx文件)

 

要在Excel中编辑.ijx文件,您有两个选择:

 

A.该文件可以用一.csv扩展来重命名(本章节中,我们将用这一选项,对该选项的概述,请见第16步之后)。

 

B.选择Excel作为打开.ijx文件的默认程序。在.ijx文件上右键点击,然后选择open with>选择default program(以>选择的默认程序打开)。从可用的程序列表中选择Excel,或者使用Browse(浏览)按钮,来导航到Excel。当选择Excel后,再选中Always use the selected program to open this kind of file(始终使用选中的程序来打开这类文件)的勾选。那么从现在开始,任何时间您双击一个.ijx文件,它都会以Microsoft Excel形式打开。(请注意:这些说明是针对Windows 7的)。(要查看其他Windows操作系统的说明,请参见Microsoft Windows网站)

 

1.FileListforDnsExporter.ijx文件重命名为FileListforDnsExporter.csv。(在windows浏览器中右键点击这个文件,然后选择重命名即可)
2.Microsoft Excel打开FileListforDnsExporter.csv文件。

 

这个文件就会被打开,且此excel文档将如下图T28.110所示:

 

Figure T28.110 The FileListforDnsExporter.csv file opened with Microsoft Excel.

Figure T28.110 The FileListforDnsExporter.csv file opened with Microsoft Excel.

 

 

3.删除Well(微孔门),FOV_row(视野_行)FOV_col(视野_列)这几列
4.删除包含#Plate Info(信息),Rows,<rows>,Columns,<cols>这些的第6行。
5. 用来自图片名称的各自通道名称<Channel_Name>来替代每行中的文本。

例如:在第2行中的图像名称是Image1DAPI.jpg。在本例中,<Channel_Name>用DAPI来取代

 

当您完成对FileListForDnsExporter.csv文件的编辑,它现在应如下图T28.111所示。

 

 

Figure T28.111 The FilelistForDnsExpoter.csv file in Excel after editing to remove extra column headers, plate information, and adding the channel information.

Figure T28.111 The FilelistForDnsExpoter.csv file in Excel after editing to remove extra column headers, plate information, and adding the channel information.

 

在Excel中,有很多方法来自动化从您文件的路径名中拖拽通道名的任务。在本教程中,我们不会介绍这些方法,但下面有一个例子,来介绍如何利用"MID"来从A2单元格中,自动抽出“DAPI”,如上面图T28.111所示。公式“=MID(A2,106,4)”表示执行MID功能(从一个文本串中间得到字符),文本位于单元格A2,开始于第106个字符,长度是4个字符(图T28.112)。

 

Figure T28.112 An example of using functions or formulas in Excel to automatically fill columns in the Analysis Configuration file.

Figure T28.112 An example of using functions or formulas in Excel to automatically fill columns in the Analysis Configuration file.

 

6. 保存您刚才编辑的FileListForDnsExporter.csv 文件。
7.从一个资源管理器窗口重命名FileListforDnsExporter.csv文件FileListforDnsExporter.ijx。

 

如果您想要为其他群组创建一个.ijx文件,例如基于多个域的数据、拼接/平铺图片、基于板子的数据或者基于板子多个域的数据,请按照以上步骤编辑您的.ijx文件,但应用于群组每个特殊类型的格式定义在ImageJ Macro帮助项目下。