FCS Express 4 Image Cytometry介绍 |
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FCS Express 4 Image Cytometry介绍 |
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为图像细胞分析数据设计的流式细胞分析环境
FCS Express 4 Image Cytometry(FCS Express第4版图像细胞分析软件)是FCS Express的一个新的成员，包含炫目和独特的处理图像细胞数据的工具。
本教程旨在对很多有用的新工具提供一个概述，让用户可以像处理流式细胞数据那样处理图像数据。现在你可以把基于细胞群的图像分析和基于单个细胞的图像分析结合起来。
本教程有三个部分，通过使用已有的例子，我们向您演示如何使用FCS Express 4 Image Cytometry。这一教程和De Novo Software网站上的介绍FCS Express 4 Image Cytometry使用方法的视频相互呼应。我们建议您看完视频之后再开始阅读本教程。这样您就会更好地理解本概述以及数据代表的生物问题。
在本章中，你将导入和查看图像数据组，建立和修改门操作，在细胞列表中查看单个细胞以及使用High Content Add-on(高涵量添加包)来优化和查看一个96-孔板细胞核易位实验。高涵量添加包让用户可以查看这个细胞板上的多个参数结果和图像。
我们会提供一个批处理分析以及FCS Express报表工具的简短例子。本教程不会对和FCS Express 4相同的那部分功能进行详细讲解，因为它们在已有的教程中详细讲解过了。当遇到相关操作时，本章将直接引用FCS Express 4教程中的相关教程。
在本章中，我们将会具体地:
| • | 演示导入图像细胞分析数据以及对图像的操作 |
| • | 在有细胞图像列表的数据网格中查看门中的细胞群 |
| • | 查看图像细胞分析相关的报表数据 |
| • | 对一个细胞核运输实验进行优化 |
| • | 使用"高涵量分析"模块来对96-孔细胞板中的基于图像的实验进行分析 |
| • | 查看批处理分析以及和图像细胞分析相关的报表选项 |
因为图像数据占用空间很大，我们在每一节教程中只处理几个图片。这些图片嵌入在了样本版面中。在"高涵量添加包"实例中，我们的教程样本数据库中不提供所有的96-孔板的数据。如果你想在本介绍性教程上进一步练习并且使用整个实验对应的数据，请查看CellProfiler导出教程中的步骤。