该教程中:

我们将学习通过Batch Processing(批处理)如何分析数据和获得快照。
我们将学习在Batch Processing(批处理)中,怎样Run(运行)Rerun(重新运行)Review(查看)分析。
oRun(运行)- 将对每个循环运行批处理和执行所有选中的批操作。每个循环的快照将自动采集。
oRerun(重新运行)- 将对每个循环重新运行前面的批处理和执行所以选中的批操作。在重新运行过程中,任何之前FCS Express保存的快照都将自动被重新应用。这也是用户可以重新圈门和利用新门重写之前保存的快照的机会。
oReview(查看)- 将对每个循环重新运行前面的批处理,但不执行创建和选中的任何批操作。
我们将学习新的、可用的Batch Processing Options(批处理选项)及在分析中它是如何被用来重放快照标记的。
我们将学习如何Flag(标记)一个循环,用以在批处理完成后进一步的查看。
这一教程中使用的版面包括一个Save to Powerpoint(保存到Powerpoint)的批操作。这一教程是设定在用户知道如何创建Batch Processing Actions(批处理操作)来执行每个循环数据的基础上的。

 

运行批处理和自动保存快照

1.File(文件)标签→Open(打开),来到Tutorial Sample Data(教程样本数据库)文件夹。
2.请打开BPSnapshots.fey版面。

该版面包括已存在于数据列表中的3个迭代数据。该版面也包含有1个Save to PowerPoint(保存至PowerPoint文稿)批处理操作,它被指定为保存到Current Windows User(当前Windows用户)的桌面上。这一教程,我们将聚焦于怎样设置批处理选项,从而让用户在批处理时能有机会优化圈门。

3.请点击Batch(批处理)标签→Batch Processing(批处理)→Options(选项)(图12)。
Figure 12 - Batch Processing Options Button

Figure 12 - Batch Processing Options Button

 

向着Batch Processing Options(批处理选项)的中间,此处有几个暂停选项,用以决定分析时,FCS Express是否在循环间暂停及FCS Express在什么时间暂停。

4.选择Unconditionally pause between iterations(无条件的在循环间暂停批处理)(图13)。
5.点击OK
Figure 13 - Batch Processing Options - Unconditionally Pause Between Iterations

Figure 13 - Batch Processing Options - Unconditionally Pause Between Iterations

6.Batch(批处理)Batch Processing(批处理)中,点击Run(运行)按钮。

 

Microsoft PowerPoint将自动打开。当批处理结束时,您可以最小化PowerPoint。且Batch Processing(批处理)窗口也会出现,用以显示当前操作、当前循环进度和整体循环进度状态。

在第一次暂停时,对循环#2进行如下调整(图14):

7.在SSC/V500绘图中,调整红色的门到集群细胞周围(图14number1)。
8. 在右边的BV421 vs BV605 绘图中,调整紫色门道集群细胞周围(图14number2)。
9. 添加一个Quadrant(象限)到FITC vs BV605绘图中(图14number3)。
10. 在APC一维柱状图中,调整Marker(标识)到峰值的两边(图14number4)。
11. 请在Batch Processing progress(批处理进程)窗口点击Flag(标记)图表(图14number5)。

 

 

Figure 14 - Steps for 2nd Iteration Analysis

Figure 14 - Steps for 2nd Iteration Analysis

12.在批处理进程窗口,点击Continue(继续)(图15)。
Figure 15 - Continuing with Batch Processing

Figure 15 - Continuing with Batch Processing

在第二个暂停处,做如下调整(图16):

13.在SSC/V500绘图中,调整红色的门到集群细胞周围(图16number1)。
14. 在BV421 vs BV605绘图中,调整蓝色的门到左上角的集群细胞周围,调整紫色的门到右下角的集群细胞周围(图16number2)。
15. 在PE vs PerCP Cy5.5 绘图中,如图5一样调整现象(图16number3)。
16. 在FITC vs BV605绘图中,如图片一样调整象限(图16number4)。
17. 在APC一维柱状图中,调整标识M1到第一个峰的两边,创建一个新标识M2,调整它到第二个峰的两边(图16number5)。
18. 在Batch Processing progress(批处理进程)窗口点击Continue(继续)按钮。在批处理完结时,PowerPoint将打开。

 

Figure 16 - Steps for 3rd Iteration Analysis

Figure 16 - Steps for 3rd Iteration Analysis

FCS Express已经自动为每个循环分析采集快照。

a.要查看采集的快照,您可以Rerun(重新运行)这一批处理,也可Review(查看)这一数据。
b. 在批处理中,使用Previous/Next(上一个/下一个)按钮,可移动采集的任何形式的快照。
c.以下步骤将详细介绍在批处理中,如何查看采集的快照。

 

Rerunning Batch Processing(重新运行批处理)

1.点击Batch(批处理)Batch Processing(批处理) Run(运行)下面的三角形。
2.从下拉列表中选择Rerun(重新运行)(图17)。
Figure 17 - Rerunning Batch Processing

Figure 17 - Rerunning Batch Processing

此时,与前面相同的过程将会发生。因为我们已经将批处理暂停选项设置为Unconditionally pause between iterations(无条件在循环间暂停),因此每个循环后FCS Express将继续暂停。但是,如何您想练习其他选项,此处,您将找到一个关于Batch Processing Options(批处理选项)的总结。请注意:FCS Express仍将进行所以循环的分析。但FCS Express只在选项中指定的循环处暂停。
3.在进程窗口点击Continue(继续),以继续Rerun(重新运行)进程。

对门、标识和象限最任何您认为必需的改动。如果您不想做任何更改,点击Run to end(运行到底)

如果对门、标识和/或象限做了任何更改,FCS Express将为循环记录一个新的快照,也将对之前针对循环的已存在的快照进行重写。
在重新运行进程中,FCS Express也可执行作为进程一部分的任何批操作。

 

Reviewing Data(回看数据)

Review(回看)可给用户查看其循环数据和更改门、标识或者象限位置的机会。但是,FCS Express不会执行任何处于查看模式时设置的批处理操作。

如前面一样,在批处理中,用户可控制FCS Express在何时暂停。在之前练习时,我们设置的是unconditionally pause between each iteration(无条件的在循环间暂停)。这次,我们将告诉FCS Express,我们只想查看在分析时标记的循环。在这一练习中,我们标记第二个循环,因此,FCS Express只在该循环处暂停。

1.从Batch(批处理)Batch Processing(批处理)中点击Options(选项)
2.选中Pause on flagged iterations(遇到有标记的循环时,请暂停) (列表如下)(图18)。

在批处理时,FCS Express将自动添加任何用户标记的循环。在我们的例子中,请将数字2列为需暂停的选项。

Figure 18 - Pause on Flagged Iterations

Figure 18 - Pause on Flagged Iterations

通过Review(查看)命令,我们可在分析未完成任何批操作时查看数据和采集的快照,来到Batch(批处理)Batch Processing(批处理)

3. 请点击位于Batch(批处理)→Batch Processing(批处理)中的Run(运行)按钮下的三角形。
4.从下拉列表中选择Review(查看)(图19)。
Figure 19 - Review

Figure 19 - Review

5.一旦查看进程开始,另一个批处理进程窗口将出现。
6.请做任何您想做的更改。点击Continue(继续)或者Run to end(运行到底)来完成该进程。