定量流式细胞仪用来确定标识每个微粒的荧光配体的实际数量(荧光染料或荧光染料-蛋白质共轭分子)。该方法需要用已知的荧光染料标准物来校正荧光通道数。该标准物用来定义观察到的荧光强度与实际荧光染料分子数目间的关系。

 

有几家公司特别设计出了有不同荧光强度的小珠，每个小珠上染料分子数精确控制。通过做一条关联通道编号和每个珠子上染料分子数目的标准曲线，可以精确决定一细胞抗原分子、抗体分子和其它标识分子的数目。

 

这类工作以前非常费力，要求用户使用流式细胞软件从珠子和样品获得一系列统计数据，然后把统计数据输入电子表格、绘成校正曲线、确定标准通道值，最后再使用该电子表格进行一些计算，将统计数据转化为每个细胞的配体数。

 

FCS Express可把整个工程自动化。一旦做好了通道校正，所有绘图会自动显示校正数轴，统计数据会显示为校正数值。标记可以被用来monitor if a calibration has been applied to an axis(监控已应用校正的坐标轴)或者last channel calibration loaded in the layout(导入版面的最后的通道校正)是什么。为了设置一个通道校正，您必须要有一组携带荧光分子数目确定的珠子来做参照。另外，必须知道有效荧光强度-蛋白质比率，以决定细胞上某一标识分子的数目。