在本例中,我们将:
• | 打开一个以前创建的版面。 |
• | 创建矩形门、椭圆形门、多边形门以及自由形门。 |
• | 更改一个数据文件。 |
• | 在二维绘图上创建一个一维门。 |
• | 用标识来创建一维门。 |
• | 把象限转化为门。 |
用户在跟着本教程练习过程中,可以使用自己的数据,也可以使用本教程提供的样本数据。样本数据文件可在FCS文件。section5.fey版面、ApoMono.001和ApoMono.002数据文件将会用到。
要打开一个版面:
1. | 选择File(文件)标签→Open(打开)(图T3.1). |
2. | 选择section5.fey版面文件位于 FCS文件从版面导入对话框中。 |
3. | 选择Data(数据)→Change Data on All Objects(修改所有对象上的数据)→Select(选中)命令,在绘图中插入数据文件(图T3.4). |
4. | 选择ApoMono.001位于教程样本数据库文档中的 FCS文件. |
5. | 点击Open(打开)。 |
版面应该看起来如图T4.0所示。
Figure T4.0 Section5 layout after file loading
下面我们将在版面不同绘图中插入四种不同类型的门。
创建门最方便的方法是使用Gates(门)Create Gates(创建门)"设门"(图 T4.1) ,但使用来自2D绘图弹出菜单中的Create Gate(创建门)来创建除了(1D)标记外的所有门(右键点击绘图来调出弹出菜单)。这些门操作命令请见图T4.1,对它们的解释见下边的表格。
注意:如何对从多孔细胞盘里获取的数据进行门操作,将在之后教程中介绍(参见Analyzing Data in Heat Maps(分析热图中的数据)部分)。
图T4.1设门命令
Symbol(图标) |
Description(描述) |
插入椭圆形门 |
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插入矩形门 |
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插入多边形门 |
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插入自由形门 |
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插入标识 |
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插入象限 |
如果把鼠标简单移动到Gates(门)组中的任何一个命令上方,系统会显示一个关于该命令的描述信息。
要查看门操作命令提示信息(图T4.2):
5. | 请把鼠标移动到Rectangle(矩形 )创建 按钮上。 |
6. | 保持鼠标半秒钟不动。 |
图T4.2设门命令提示
要创建矩形门:
7. | 选择"设门"→Create Gates(创建门)→Rectangle(矩形门)命令(图T4.1![]() |
命令被选中时,因该按钮会有一个不同的颜色背景,用户知悉该选项处于点中状态.
我们会在密度图的左上方来创建一个矩形门(被称为“在绘图上 创建矩形门")(图T4.3)。
Figure T4.3 Density Plot for First Gating Excercise
8. | 将光标移动到绘图中您想要矩形门开始的位置。 |
9. | 按并按住鼠标左键不放。 |
10. | 将光标移动到绘图中您想要矩形门终止的位置(图T4.4)。 |
11. | 放开鼠标键。 |
在图上创建矩形门。
图T4.4 创建多边形门
。Create New Gate (创建新门)对话框将出现(图T4.5)。请为新门取个名称。
图T4.5创建新门对话框
12. | 请在创建一个新门名称编辑域中输入"Cells in a freeform"。 |
13. | 点击OK键,来接受该名称。 |
这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6)。
Figure T4.6 Newly Created Rectangular Gate
注:在第7-12步骤中的任何时间,您可以通过按下键盘上的ESC键来取消对门的创建。该操作可应用于所有类型的门。
要创建椭圆形门:
14. | 选择"设门"→Create Gates(创建门)→Ellipse(椭圆形门)命令(图T4.1![]() |
命令被选中时,因该按钮会有一个不同的颜色背景,用户知悉该选项处于点中状态.
我们将在密度绘图的右上角创建一个椭圆形门(被称作“在这个绘图上创建”。)
15. | 跟着上面的第8-11步来创建一个椭圆形门。 |
16. | 请在创建一个新门名称编辑域中输入"Cells in a freeform"。 |
17. | 按OK键,来接受该名称。 |
这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6b)。
Figure T4.6b Newly Created Elliptical Gate
要创建多边形门:
我们将在密度图的左下方创建一个多边形门(被称作创建”。)
18. | 选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Polygon(多边形门)命令(图T4.1![]() |
命令被选中时,因该按钮会有一个不同的颜色背景,用户知悉该选项处于点中状态.
19. | 将光标移动到绘图中您想要添加多边形门第一个顶点的位置。 |
20. | 按下鼠标左键。该多边形门的第一个顶点就被创建好了。 |
21. | 将光标移动到绘图中您想要添加多边形门第二个顶点的位置。 |
22. | 按下鼠标左键。该多边形门的第二个顶点就被创建好了。 |
23. | 请重复第19-22步,直到你想要关闭该多边形门。 |
24. | 通过点击第20步您创建的第一个顶点,来将多边形门封闭。或者,用户可以按下空格键来关闭该多边形。 |
一个Create New Gate (创建新门)对话框将出现,如图T4.5所示。请为新门取个名称。
25. | 请在创建一个新门名称编辑域中输入"Cells in a freeform"。 |
26. | 点击OK键,来接受该名称。 |
这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6)。
Figure T4.7 Polygon Gate
要创建自由形门:
我们将在密度图的右下方创建自由形门(被称作“在绘图上创建自由形门”。)
27. | 选择Gating(门操作)→Create Gates(创建门)→Freeform(自由形门)命令(图T4.1![]() |
命令被选中时,因该按钮会有一个不同的颜色背景,用户知悉该选项处于点中状态.
28. | 请把光标移动到想要开始创建自由形门的位置。 |
29. | 按下鼠标左键不放。 |
30. | 请移动鼠标来画出想要的形状,在移动过程中请不要松开鼠标。画门的过程中,会有一条线跟着光标,显示门会在哪儿出现。 |
31. | 请松开鼠标来完成该门的创建(图T4.8)。 |
一个Create New Gate (创建新门)对话框将出现,如图T4.5所示。请为新门取个名称。
32. | 请在创建一个新门名称编辑域中输入"Cells in a freeform"。 |
33. | 点击OK键,来接受该名称。 |
这时该门、一个显示其名称的文本框和% of gated cells(门中细胞所占百分比)会出现在绘图上(图T4.6b)。
Figure T4.8 Freeform Gate